LOADING...
Go to filter Work Stopped Failed In Progress Success Popup Filter
Click anywhere on bar below to display a new range.
Record Selection: 1  1 1001  Next 239  1239   Records per Page
JCSG Target List Report Date: Thu 17-May-2012 05:45:18
 No.   Target ID   Target Name   Protein Accession   Species   Description   PDB   Active   PCR   Cloned   Expression   Purified   Crystal   Data Set   Structure   PDB 
 1   371986   ME9797A   104161995   uncultured Thermotogales bacterium   predicted HD superfamily hydrolase   PDB  2pq7
 2   367064   FG7480A   NP_636471.1   X. campestris   A zinc-binding protein from cupin superfamily involved in tetracenomycin polyketide synthesis   PDB  3h50
2ilb
 3   380344   FG7482A   NP_637619.1   X. campestris   Putative General Stress Protein 26 with a PNP-Oxidase like fold   PDB  3dmb
 4   371319   FK5749A   NP_639141.1   X. campestris   haloacid delahogenase-like family hydrolase   PDB  2pke
 5   371737   FK8795C   NP_638301.1   X. campestris   Acetyltransferase [Acyl-CoA N-acyltransferases]   PDB  2ozh
 6   383078   FP4107A   NP_639225.1   X. campestris   Serine hydrolase (alpha/beta hydrolase) [DPP6 catalytic domain-like] with a conserved catalytic triad (S108/D186/H217)   PDB  3ksr
 7   391539   MG14561F   NP_635776.1   X. campestris   Putative polyketide cyclase from Xanthomonas campestris [Cystatin-like]   PDB  3i0y
 8   391540   MG14655B   NP_639274.1   X. campestris   Protein of unknown function with cystatin-like fold.   PDB  3g8z
 9   372467   PG9920A   NP_636912.1   X. campestris   Putative hydrolase of the alpha/beta superfamily [Atu1826-like].   PDB  2qjw
 10   396520   PX11702A   NP_636218.1   X. campestris   Putative calcium/calmodulin dependent protein kinase II association domain   PDB  3h51
 11   380229   GN7729A   JCVI_PEP_1096686650277   Unknown   Protein structurally similar to Sm/LSm-like RNA-binding proteins   PDB  3by7
 12   367476   GN7730A   JCVI_PEP_1096672785533   Unknown   Dimeric ferredoxin-like protein   PDB  2op5
 13   367439   GN7738A   JCVI_PEP_1096665735785   Unknown   dimeric ferredoxin-like protein   PDB  2od4
 14   367491   GN7747A   JCVI_PEP_1096688149193   Unknown   Putative nucleic acid binding protein   PDB  2od5
 15   367441   GN7757A   JCVI_PEP_1096682647733   Unknown   Dimeric ferredoxin-like protein from an environmental metagenome.   PDB  2od6
 16   367457   GN7773A   JCVI_PEP_1096685590403   Unknown   Marine metagenome protein with structure similar to oxygenases   PDB  2pgc
 17   400673   FR14695A   NP_110623.1   T. volcanium   Putative nitrate transport protein [Phosphate binding protein-like]   PDB  3mst
 18   281896   TM0015   TM0015   T. maritima   Pyruvate synthase subunit PORC (EC 1.2.7.1) (Pyruvate oxidoreductase gamma chain) (POR) (Pyruvic-ferredoxin oxidoreductase gamma subunit).   PDB  2raa
 19   281902   TM0021   TM0021   T. maritima   Putative PII-like signaling protein [Ferredoxin-like]   PDB  1o51
1o2c
 20   281945   TM0064   TM0064   T. maritima   Uronate isomerase (EC 5.3.1.12) (Glucuronate isomerase) (Uronic isomerase).   PDB  1j5s
 21   281947   TM0066   TM0066   T. maritima   2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase (EC 4.1.2.14) / 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (EC 4.1.3.16)   PDB  1vlw
 22   281948   TM0067   TM0067   T. maritima   2-dehydro-3- deoxygluconokinase (EC 2.7.1.45)   PDB  2afb
1j5v
 23   281958   TM0077   TM0077   T. maritima   Putative acetyl xylan esterase.   PDB  3m82
3m83
3m81
1vlq
 24   282000   TM0119   TM0119   T. maritima   Acetamidase, putative.   PDB  2f4l
 25   282020   TM0140   TM0140   T. maritima   Indole-3-glycerol phosphate synthase (EC 4.1.1.48) (IGPS).   PDB  1j5t
 26   282039   TM0159   TM0159   T. maritima   Putative Xanthosine triphosphate pyrophosphatase (EC 3.6.1.-)/HAM1 protein homolog [ITPase (Ham1)].   PDB  1vp2
 27   358348   TM0160   TM0160   T. maritima   DUF151 family protein related to wound induced proteins in plants [ Hypothetical protein TM0160]   PDB  1sj5
 28   282040   TM0160   TM0160   T. maritima   DUF151 family protein related to wound induced proteins in plants [ Hypothetical protein TM0160]   PDB  1vjl
1o5y
 29   282041   TM0161   TM0161   T. maritima   Geranyltranstransferase (EC 2.5.1.10)   PDB  2ftz
 30   282046   TM0166   TM0166   T. maritima   Dihydrofolate synthase (EC 6.3.2.12) / Folylpolyglutamate synthase (EC 6.3.2.17)   PDB  1o5z
 31   282055   TM0175   TM0175   T. maritima   Acyl carrier protein (ACP).   PDB  1vku
 32   358402   TM0189   TM0189   T. maritima   Putative periplasmic Fe(III) ABC transporter.   PDB  2etv
 33   282087   TM0207   TM0207   T. maritima   Putative Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily [Metallo-hydrolase/oxidoreductase]   PDB  1vjn
 34   282092   TM0212   TM0212   T. maritima   Putative glycine cleavage system H protein   PDB  1zko
2ka7
 35   282095   TM0215   TM0215   T. maritima   Putative endoribonuclease [YjgF/L-PSP]   PDB  2b33
 36   282096   TM0216   TM0216   T. maritima   Glycyl-tRNA synthetase alpha chain (EC 6.1.1.14)   PDB  1j5w
 37   282110   TM0231   TM0231   T. maritima   UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase MurC (EC 6.3.2.8) (UDP-N- acetylmuramoyl-L-alanine synthetase).   PDB  1j6u
 38   358404   TM0246   TM0246   T. maritima   Putative RnfG subunit of electron transport complex.   PDB  3dcz
 39   282139   TM0262   TM0262   T. maritima   DNA polymerase III, beta subunit.   PDB  1vpk
 40   282146   TM0269   TM0269   T. maritima   Activation (AdoMet binding) domain of Methionine synthase (EC 2.1.1.13)   PDB  1j6r
 41   282169   TM0293   TM0293   T. maritima   Gamma-glutamyl phosphate reductase (GPR) (EC 1.2.1.41) (Glutamate-5- semialdehyde dehydrogenase) (Glutamyl-gamma-semialdehyde dehydrogenase) (GSA dehydrogenase).   PDB  1o20
 42   282171   TM0295   TM0295   T. maritima   Transaldolase (EC 2.2.1.2).   PDB  1vpx
 43   282188   TM0312   TM0312   T. maritima   Oxidoreductase (EC 1.1.1.-)   PDB  1zh8
 44   282196   TM0320   TM0320   T. maritima   Heavy metal binding protein.   PDB  2kyz
 45   282207   TM0332   TM0332   T. maritima   Orotidine 5'-phosphate decarboxylase (EC 4.1.1.23) (OMP decarboxylase) (OMPDCase) (OMPdecase).   PDB  1vqt
 46   282218   TM0343   TM0343   T. maritima   Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase (EC 2.5.1.54) (DAHP synthase)   PDB  1vr6
 47   354146   TM0378   TM0378   T. maritima   glycerol-3-phosphate dehydrogenase   PDB  1z82
 48   282288   TM0415   TM0415   T. maritima   Carbohydrate kinase, PfkB family   PDB  1vk4
 49   282296   TM0423   TM0423   T. maritima   Glycerol dehydrogenase.   PDB  1kq3
 50   282309   TM0436   TM0436   T. maritima   Alcohol dehydrogenase, zinc-containing.   PDB  1vj0
 51   359776   TM0441   TM0441   T. maritima   Gluconate 5-dehydrogenase (EC 1.1.1.69)   PDB  1vl8
 52   282319   TM0446   TM0446   T. maritima   Phosphoribosylaminoimidazole mutase catalytic subunit (EC 4.1.1.21) (AIR carboxylase) (AIRC).   PDB  1o4v
 53   282322   TM0449   TM0449   T. maritima   Thy1-Complementing Protein Thymidylate synthase thyX (EC 2.1.1.) (TS) (TSase).   PDB  1kq4
 54   282359   TM0486   TM0486   T. maritima   TM0486 (DUF77 family) thiamin-binding protein [MTH1187-like].   PDB  1vk8
 55   282360   TM0487   TM0487   T. maritima   Conserved PaaD-like protein of unknown function; possibly involved with Fe-S cluster metabolism.   PDB  1wcj
1uwd
 56   282361   TM0488   TM0488   T. maritima   N5-glutamine methyltransferase, HemK(EC 2.1.1.-)   PDB  1vq1
 57   282365   TM0492   TM0492   T. maritima   Tryptophanyl-tRNA synthetase (EC 6.1.1.2) (Tryptophan--tRNA ligase) (TrpRS).   PDB  2g36
 58   359753   TM0511   TM0511   T. maritima   Uracil-DNA glycosylase (EC 3.2.2.-)   PDB  1vk2
 59   282415   TM0542   TM0542   T. maritima   NAD-dependent malic enzyme (EC 1.1.1.38)   PDB  1vl6
 60   282417   TM0544   TM0544   T. maritima   ABC transporter ATP-binding protein.   PDB  1vpl
 61   282429   TM0556   TM0556   T. maritima   3-isopropylmalate dehydrogenase (EC 1.1.1.85) (Beta-IPM dehydrogenase) (IMDH) (3-IPM-DH).   PDB  1vlc
 62   282432   TM0559   TM0559   T. maritima   Predicted metal-dependent phosphoesterase (PHP family)   PDB  2anu
 63   282434   TM0561   TM0561   T. maritima   Magnesium Mg(2+)/cobalt Co(2+) transport protein.   PDB  2iub
 64   282443   TM0570   TM0570   T. maritima   Cell division protein ftsY.   PDB  1vma
 65   282447   TM0574   TM0574   T. maritima   S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase (EC 5.-.-.-) (Queuosine biosynthesis protein queA).   PDB  1vky
 66   282454   TM0581   TM0581   T. maritima   Putative thioesterase TM0581.   PDB  2q78
 67   282476   TM0603   TM0603   T. maritima   30S ribosomal protein S6.   PDB  1vmb
 68   282477   TM0604   TM0604   T. maritima   Single stranded DNA-binding protein.   PDB  1z9f
 69   282486   TM0613   TM0613   T. maritima   Nucleotide binding domain (HEPN) of the two-protein nucleotidyl transferase complex   PDB  1o3u
 70   282527   TM0655   TM0655   T. maritima   S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme (EC 4.1.1.50) (AdoMetDC) (SamDC) [Contains: S-adenosylmethionine decarboxylase beta chain; S- adenosylmethionine decarboxylase alpha chain].   PDB  1vr7
 71   282530   TM0658   TM0658   T. maritima   Putative superoxide reductase [Superoxide reductase-like]   PDB  3qzb
2amu
 72   282537   TM0665   TM0665   T. maritima   O-acetylserine sulfhydrylase   PDB  1j6n
1o58
 73   282539   TM0667   TM0667   T. maritima   TatD-related deoxyribonuclease   PDB  1j6o
 74   356088   TM0680   TM0680   T. maritima   the C-terminal fragment of the putative flagellar motor switch protein FliN     1o6a
 75   360368   TM0693   TM0693   T. maritima   Putative RNA binding protein.   PDB  2g42
2fzt
 76   282586   TM0716   TM0716   T. maritima   Acetyl-coenzyme A carboxyl transferase (EC 6.4.1.2) / Propionyl-coenzyme A carboxyl transferase (EC 6.4.1.3) / Biotin:Acyl-CoA transcarboxylase chain   PDB  1vrg
 77   282591   TM0721   TM0721   T. maritima   Uracil phosphoribosyltransferase (EC 2.4.2.9) (UMP pyrophosphorylase) (UPRTase).   PDB  1o5o
 78   282593   TM0723   TM0723   T. maritima   Putative thiamin phosphate synthase   PDB  1vmj
 79   282597   TM0727   TM0727   T. maritima   Putative modulator of DNA gyrases [Putative modulator of DNA gyrase, PmbA/TldD]   PDB  1vl4
 80   359843   TM0741   TM0741   T. maritima   Phosphopantetheine adenylyltransferase (EC 2.7.7.3) (Pantetheine- phosphate adenylyltransferase) (PPAT) (Dephospho-CoA pyrophosphorylase).   PDB  1vlh
 81   282618   TM0748   TM0748   T. maritima   SAM-dependent O-methyltransferase   PDB  1o54
 82   282622   TM0752   TM0752   T. maritima   alpha-glucuronidase (EC 3.2.1.139).   PDB  1vjt
 83   282625   TM0755   TM0755   T. maritima   Flavoprotein   PDB  1vme
 84   360384   TM0771   TM0771   T. maritima   DNA polymerase III, gamma subunit-related protein.   PDB  2gno
 85   282666   TM0796   TM0796   T. maritima   Putative nucleotide binding protein   PDB  2g0t
 86   282670   TM0800   TM0800   T. maritima   putative nitroalkan dioxygenase   PDB  3bo9
 87   282683   TM0813   TM0813   T. maritima   Glucosamine-6-phosphate deaminase (EC 3.5.99.6)   PDB  1j5x
 88   282684   TM0814   TM0814   T. maritima   N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase.   PDB  1o12
 89   282686   TM0816   TM0816   T. maritima   Putative transcriptional regulator from the MarR family   PDB  2eth
 90   282690   TM0820   TM0820   T. maritima   NADH-dependent butanol dehydrogenase A (EC 1.1.1.-)   PDB  1vlj
 91   282698   TM0828   TM0828   T. maritima   Possible 1-phosphofructokinase (EC 2.7.1.56)   PDB  1o14
2ajr
 92   282701   TM0831   TM0831   T. maritima   Probable branched-chain amino acid aminotransferase (EC 2.6.1.42) (BCAT).   PDB  3csw
 93   282725   TM0855   TM0855   T. maritima   Ribosome-binding factor A.   PDB  2kzf
 94   282743   TM0874   TM0874   T. maritima   Glycoprotein endopeptidase   PDB  2a6a
 95   282744   TM0875   TM0875   T. maritima   An orphan protein with a new fold from Thermotoga maritima.   PDB  1o22
 96   359866   TM0881   TM0881   T. maritima   Homoserine O-succinyltransferase (EC 2.3.1.46) (Homoserine O- transsuccinylase) (HTS).   PDB  2h2w
 97   282761   TM0892   TM0892   T. maritima   CBS domain protein/ACT domain protein [CBS-domain pair]   PDB  1vr9
 98   359759   TM0894   TM0894   T. maritima   putative metallo-beta-lactamase   PDB  1ztc
 99   282784   TM0915   TM0915   T. maritima   Ribonuclease HII (EC 3.1.26.4) (RNase HII).   PDB  2etj
 100   282788   TM0919   TM0919   T. maritima   Hydroperoxide resistance protein OsmC   PDB  1vla
 101   375013   TM0920   TM0920   T. maritima   Alcohol dehydrogenase, iron-containing.   PDB  1o2d
1j5r
 102   282791   TM0922   TM0922   T. maritima   Putative carbohydrate kinase   PDB  2ax3
 103   282804   TM0935   TM0935   T. maritima   CBS domain-containing protein [CBS-domain pair]   PDB  1o50
 104   282805   TM0936   TM0936   T. maritima   Metal-dependent hydrolase of cytosinedemaniase/chlorohydrolase family.   PDB  1j6p
 105   358444   TM0957   TM0957   T. maritima   OB-fold protein   PDB  2f4i
 106   282829   TM0960   TM0960   T. maritima   Ribokinase.   PDB  1vm7
 107   358514   TM0961   TM0961   T. maritima   LEMA protein [Bromodomain-like]   PDB  2etd
 108   282848   TM0979   TM0979   T. maritima   Putative sulfur transferase   PDB  1rhx
 109   282876   TM1009   TM1009   T. maritima   2,5-diketo-D-gluconic acid reductase (EC 1.1.1.274)   PDB  1vp5
 110   282877   TM1010   TM1010   T. maritima   cupin-like protein [Double-stranded beta-helix]   PDB  2f4p
 111   282879   TM1012   TM1012   T. maritima   Putative nucleotidyltransferase [TM1012-like]   PDB  2ewr
2fcl
 112   282897   TM1030   TM1030   T. maritima   Transcriptional regulator, TETR family.   PDB  1zkg
 113   282903   TM1036   TM1036   T. maritima   Imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisF (EC 4.1.3.-) (IGP synthase cyclase subunit) (IGP synthase subunit hisF) (ImGP synthase subunit hisF) (IGPS subunit hisF).   PDB  2a0n
 114   359801   TM1040   TM1040   T. maritima   Histidinol-phosphate aminotransferase (EC 2.6.1.9) (Imidazole acetol- phosphate transferase).   PDB  2f8j
 115   282916   TM1049   TM1049   T. maritima   Endoglucanase.   PDB  2fvg
 116   282917   TM1050   TM1050   T. maritima   Endoglucanase.   PDB  3isx
 117   282923   TM1056   TM1056   T. maritima   Periplasmic divalent cation tolerance protein.   PDB  1o5j
 118   282947   TM1080   TM1080   T. maritima   Ribose 5-phosphate isomerase RpiB(EC 5.3.1.6)   PDB  1o1x
 119   282948   TM1081   TM1081   T. maritima   Putative anti-sigma factor antagonist TM1081 [SpoIIaa-like]   PDB  3f43
2ka5
 120   282950   TM1083   TM1083   T. maritima   Archease, possible chaperone from DUF101 group   PDB  1j5u
 121   358957   TM1088A   TM1088A   T. maritima   Putative transport protein. N-terminal domain of TrkA protein from NAD(P)-binding Rossmann-domain fold. Possibily involved in potassium or calcium uptake.   PDB  2g1u
 122   358959   TM1088A:TM1088B   TM1088A   T. maritima   Putative transport protein. N-terminal domain of TrkA protein from NAD(P)-binding Rossmann-domain fold. Possibily involved in potassium or calcium uptake.   PDB  3l4b
 123   406264   TM1088B   TM1088B   T. maritima   Putative transport protein, part of the K+ channel [TrkA C-terminal domain-like]   PDB  3jxo
 124   358959   TM1088B:TM1088A   TM1088B   T. maritima   Putative transport protein, part of the K+ channel [TrkA C-terminal domain-like]   PDB  3l4b
 125   282963   TM1097   TM1097   T. maritima   Ornithine carbamoyltransferase (EC 2.1.3.3) (OTCase).   PDB  1vlv
 126   282968   TM1102   TM1102   T. maritima   Ribonuclease III (EC 3.1.26.3) (RNase III).   PDB  1o0w
 127   282978   TM1112   TM1112   T. maritima   Novel Thermotoga maritima protein from the DUF861 family and cupin fold.   PDB  2k9z
1o5u
 128   282994   TM1128   TM1128   T. maritima   Ferritin.   PDB  1vlg
 129   282997   TM1131   TM1131   T. maritima   Aminotransferase, putative.   PDB  1vp4
 130   420134   TM1135   TM1135   T. maritima   leucine specific ABC transporter, periplasmic binding protein LivK   PDB  3td9
 131   283020   TM1154   TM1154   T. maritima   6-phosphogluconolactonase (EC 3.1.1.31) (6PGL).   PDB  1vl1
 132   283024   TM1158   TM1158   T. maritima   putative glutamine amido transferase [Flavodoxin-like]   PDB  1o1y
 133   283034   TM1169   TM1169   T. maritima   3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase.   PDB  1o5i
 134   283036   TM1171   TM1171   T. maritima   Transcriptional regulator, CrP family.   PDB  1o5l
 135   283050   TM1185   TM1185   T. maritima   Methylglyoxal synthase (EC 4.2.3.3) (MGS).   PDB  1vmd
 136   359818   TM1192   TM1192   T. maritima   Alpha-galactosidase (EC 3.2.1.22) (Melibiase).   PDB  1zy9
 137   358463   TM1223   TM1223   T. maritima   Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein.   PDB  1vr5
 138   359804   TM1224   TM1224   T. maritima   N-acetylglucosamine kinase (EC 2.7.1.59) / predicted N-acetylglucosamine repressor   PDB  2hoe
 139   283090   TM1225   TM1225   T. maritima   Predicted glycosidase   PDB  1vkd
 140   283109   TM1244   TM1244   T. maritima   Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, purS subunit (EC 6.3.5.3)   PDB  1vq3
 141   283111   TM1246   TM1246   T. maritima   Phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (EC 6.3.5.3) (FGAM synthase II).   PDB  1vk3
 142   360132   TM1249   TM1249   T. maritima   Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase (EC 2.1.2.3) / IMP cyclohydrolase (EC 3.5.4.10)   PDB  1zcz
 143   359807   TM1250   TM1250   T. maritima   Phosphoribosylamine--glycine ligase (EC 6.3.4.13) (GARS) (Glycinamide ribonucleotide synthetase) (Phosphoribosylglycinamide synthetase).   PDB  1vkz
 144   283120   TM1255   TM1255   T. maritima   Aspartate aminotransferase (EC 2.6.1.1) (Transaminase A) (AspAT).   PDB  1o4s
 145   283137   TM1272   TM1272   T. maritima   Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (EC 6.3.5.-) (Glu-ADT subunit A).   PDB  2gi3
 146   283151   TM1287   TM1287   T. maritima   putative oxalate decarboxylase (EC 4.1.1.2 ) [double-stranded beta-helix]   PDB  1o4t
 147   283154   TM1290   TM1290   T. maritima   Putative NifB protein from DUF35 family , involved in FeMo-Co biosynthesis [Ribonuclease H-like motif]   PDB  1rdu
 148   283157   TM1293   TM1293   T. maritima   SAM-dependent methyltransferase, possible histamine N-methyltransferase   PDB  1vlm
 149   283208   TM1347   TM1347   T. maritima   Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase.   PDB  1vrd
 150   283212   TM1351   TM1351   T. maritima   Glutamyl-tRNA synthetase 1 (EC 6.1.1.17) (Glutamate--tRNA ligase 1) (GluRS 1).   PDB  2o5r
 151   283228   TM1367   TM1367   T. maritima   Protein from DUF369 with an atypical cyclophilin (peptidylprolyl isomerase) fold. Putative peptidylprolyl cis-trans isomerase.   PDB  2ka0
1zx8
 152   359772   TM1380   TM1380   T. maritima   predicted RNA methyltransferase [alpha/beta knot]   PDB  1z85
 153   283246   TM1385   TM1385   T. maritima   Glucose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.9) (GPI) (Phosphoglucose isomerase) (PGI) (Phosphohexose isomerase) (PHI).   PDB  2q8n
 154   283248   TM1387   TM1387   T. maritima   Dephospho-CoA kinase (EC 2.7.1.24) (Dephosphocoenzyme A kinase).   PDB  2grj
 155   283250   TM1389   TM1389   T. maritima   Ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase-related protein.   PDB  2avn
 156   283254   TM1393   TM1393   T. maritima   2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.60)   PDB  1vpa
 157   283255   TM1394   TM1394   T. maritima   33 kDa chaperonin (Heat shock protein 33 homolog) (HSP33).   PDB  1vq0
 158   358470   TM1410   TM1410   T. maritima   Putative glycosidase with a TIM-barrel fold.   PDB  2aam
 159   283279   TM1419   TM1419   T. maritima   Myo-inositol-1-phosphate synthase-related protein   PDB  1vjp
3cin
 160   283296   TM1436   TM1436   T. maritima   Glycerol uptake operon antiterminator-related protein.   PDB  1vkf
 161   283301   TM1442   TM1442   T. maritima   Putative anti sigma factor antagonist in its phosphorylated state [SpoIIaa-like]   PDB  1t6r
1sbo
 162   283317   TM1459   TM1459   T. maritima   Novel family of manganese-containing cupin   PDB  1o5n
1vj2
 163   283322   TM1464   TM1464   T. maritima   indigoidine synthase A (IdgA)-like protein, possibly involved in carbohydrate metabolism [Indigoidine synthase A-like]   PDB  1vkm
 164   283326   TM1468   TM1468   T. maritima   Putative lipid binding protein, from the DegV family [DAK1/DegV-like]   PDB  1vpv
 165   283335   TM1478   TM1478   T. maritima   Methionine aminopeptidase (EC 3.4.11.18) (MAP) (Peptidase M).   PDB  1o0x
 166   283349   TM1492   TM1492   T. maritima   50S ribosomal protein L29.   PDB  1r73
 167   283363   TM1506   TM1506   T. maritima   ADP-ribosylated protein with unknown function   PDB  1vk9
 168   283377   TM1520   TM1520   T. maritima   Dihydrodipicolinate reductase (EC 1.3.1.26) (DHPR).   PDB  1vm6
 169   283378   TM1521   TM1521   T. maritima   Dihydrodipicolinate synthase (EC 4.2.1.52) (DHDPS).   PDB  1o5k
 170   283383   TM1526   TM1526   T. maritima   Putative ferritin-like diiron-carboxylate protein   PDB  1vjx
 171   358474   TM1553   TM1553   T. maritima   ApbE protein involved in thiamine biosynthesis   PDB  1vrm
 172   283416   TM1559   TM1559   T. maritima   Deoxyribose-phosphate aldolase (EC 4.1.2.4) (Phosphodeoxyriboaldolase) (Deoxyriboaldolase) (DERA).   PDB  1o0y
3r13
3r12
 173   283417   TM1560   TM1560   T. maritima   Formiminotetrahydrofolate cyclodeaminase (EC 4.3.1.4)   PDB  1o5h
 174   283418   TM1561   TM1561   T. maritima   Queuine tRNA-ribosyltransferase (EC 2.4.2.29) (tRNA-guanine transglycosylase) (Guanine insertion enzyme).   PDB  2ash
 175   283442   TM1585   TM1585   T. maritima   Glycerate kinase (EC 2.7.1.31)   PDB  1o0u
2b8n
 176   359768   TM1586   TM1586   T. maritima   Putative Nitroreductase (EC 1.-.-.-)   PDB  1vkw
 177   283453   TM1596   TM1596   T. maritima   Purine nucleoside phosphorylase.   PDB  1vmk
 178   283459   TM1602   TM1602   T. maritima   Transcriptional regulator, biotin repressor family.   PDB  1j5y
 179   283469   TM1612   TM1612   T. maritima   ATP synthase alpha chain (EC 3.6.3.14)   PDB  2r9v
 180   359877   TM1620   TM1620   T. maritima   Carboxymuconolactone decarboxylase family protein possibly involved in antioxidative response   PDB  1vke
 181   283478   TM1621   TM1621   T. maritima   Glycerophosphodiester phosphodiesterase (GDPD) (TM1621).   PDB  1o1z
 182   358480   TM1622   TM1622   T. maritima   GTP binding regulator   PDB  1vr8
 183   283488   TM1631   TM1631   T. maritima   Putative DNA-acting enzyme (DUF72 family)   PDB  1vpq
 184   372975   TM1635   TM1635   T. maritima   the first eubacterial Mre11 nuclease   PDB  2q8u
 185   283500   TM1643   TM1643   T. maritima   Aspartate dehydrogenase [same functional role as] (EC 1.4.3.16)   PDB  1j5p
 186   283502   TM1645   TM1645   T. maritima   type II quinolic acid phosphoribosyltransferase [decarboxylating] (EC 2.4.2.19)   PDB  1o4u
 187   283518   TM1661   TM1661   T. maritima   Peptide deformylase (EC 3.5.1.88) (PDF) (Polypeptide deformylase).   PDB  1lme
 188   283555   TM1698   TM1698   T. maritima   Aspartate aminotransferase.   PDB  2gb3
 189   283594   TM1739   TM1739   T. maritima   Putative nuclease with a ribonuclease H-like motif fold [TM1739-like].   PDB  1zup
 190   283597   TM1742   TM1742   T. maritima   4-nitrophenylphosphatase (EC 3.1.3.41)   PDB  1vjr
 191   283599   TM1744   TM1744   T. maritima   L-ALLO-threonine aldolase.   PDB  2fm1
 192   359798   TM1752   TM1752   T. maritima   Endoglucanase.   PDB  1vjz
 193   283620   TM1766   TM1766   T. maritima   Putative Formyltetrahydrofolate Synthetase   PDB  3do6
 194   283634   TM1780   TM1780   T. maritima   Argininosuccinate synthase (EC 6.3.4.5) (Citrulline--aspartate ligase).   PDB  1vl2
 195   283635   TM1782   TM1782   T. maritima   N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (EC 1.2.1.38) (AGPR) (N- acetyl-glutamate semialdehyde dehydrogenase) (NAGSA dehydrogenase).   PDB  1vkn
 196   283638   TM1785   TM1785   T. maritima   Acetylornithine aminotransferase (EC 2.6.1.11) (ACOAT).   PDB  2ord
 197   283669   TM1816   TM1816   T. maritima   Putative dinitrogenase iron-molybdenum cofactor [Ribonuclease H-like motif]   PDB  1o13
1t3v
 198   283681   TM1828   TM1828   T. maritima   Diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase (EC 3.5.4.26) / 5-amino-6- (5-phosphoribosylamino)uracil reductase (EC 1.1.1.193)   PDB  2hxv
 199   387095   EK2269L   TFUS_04MAR05_CONTIG93_REVISED_GENE318   T. fusca YX-ER1   Putative fructosamine-3-kinase.   PDB  3f7w
3d1u
 200   371241   FK9593A   YP_290423.1   T. fusca YX-ER1   The putative thioesterase II is homologous to thioesterase II from E. coli (1c8u) [Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase]   PDB  3bbj
 201   378307   FM11991A   YP_288824.1   T. fusca YX-ER1   Dimeric ferredoxin-like protein of unknown function [ferredoxin-like]   PDB  3bgu
 202   390257   FP2858A   TFUS_04MAR05_CONTIG93_REVISED_GENE761   T. fusca YX-ER1   Putative transcriptional regulator of the TetR/AcrR family is similar to C-terminal region (inducing compounds-binding) of QacR.   PDB  3dcf
 203   372019   PC00329C   YP_290749.1   T. fusca YX-ER1   NADH dehydrogenase subunit C [Nqo5-like]   PDB  3mcr
 204   361176   PC04686E   YP_290167.1   T. fusca YX-ER1   SsgA-like sporulation-specific cell division [alpha+beta class]   PDB  3cm1
 205   375255   PJ04672A   YP_290923.1   T. fusca YX-ER1   Putative methyltransferase   PDB  2qe6
 206   423184   SF20744C   TFUS_04MAR05_CONTIG93_REVISED_GENE2109   T. fusca YX-ER1   Putative cell division protein FtsZ, cell division protein, tubulin homolog, GTP-binding, cell cycle, two domains protein: Tubulin/FtsZ family domain and FtsZ family, C-terminal domain     4e6e
 207   396994   MG11810B   YP_315894.1   T. denitrificans ATCC 25259   Putative calcium/calmodulin-dependent protein   PDB  3gwr
 208   381882   10640157   10640157   T. acidophilum   Putative ribokinase.     3bf5
 209   359680   10640715   10640715   T. acidophilum   Putative FMN-binding protein     2fur
 210   370499   FJ8835A   NP_393673.1   T. acidophilum   Putative osmotically inducible protein C   PDB  2onf
 211   376023   FL10679A   NP_394282.1   T. acidophilum   putative acetyltransferase   PDB  3c26
 212   376464   FL11316A   NP_394501.1   T. acidophilum   Putative iron-molybdenum cofactor (FeMo-co) of dinitrogenase   PDB  2re2
 213   388819   FL4049A   NP_393672.1   T. acidophilum   Predicted CIB-like hydrolase   PDB  3bdi
 214   380082   FN0547A   NP_394635.1   T. acidophilum   Putative dehydrogenase   PDB  3ing
 215   382454   FP10738A   NP_393992.1   T. acidophilum   Geranylgeranyl bacteriochlorophyll reductase-like.   PDB  3oz2
3cgv
 216   356213   NP_394403.1   NP_394403.1   T. acidophilum   GMP synthase from a family of class I glutamine amidotransferases (GAT) (class I glutamine amidotransferase-like superfamily)   PDB  2a9v
 217   361192   PC02663D   10640422   T. acidophilum   Putative subunit E of formylmethanofuran dehydrogenase (FmdE/GAPDH domain-like fold)     2gvi
 218   368396   PE00037E   YP_400729.1   Synechococcus sp. PCC 7942 (elongatus)   cupin-like fold   PDB  2nvn
 219   368393   PE00042D   YP_399305.1   Synechococcus sp. PCC 7942 (elongatus)       PDB  2l1n
 220   369221   CM5490D   YP_614459.1   Silicibacter sp. TM1040   uncharacterized peroxidase-related protein   PDB  2pfx
 221   387075   EK8604E   YP_614837.1   Silicibacter sp. TM1040   Putative aminoglycoside phosphotransferase (protein kinase-like fold)   PDB  3csv
 222   371276   FK9370B   YP_614486.1   Silicibacter sp. TM1040   Putative thioesterase [Alpha/beta-Hydrolases]   PDB  2pbl
 223   376409   FL11268A   YP_613385.1   Silicibacter sp. TM1040   Putative thioesterase [hot dog-like fold]   PDB  2qwz
 224   377806   FM11526A   YP_612389.1   Silicibacter sp. TM1040   Biotin protein ligase-like protein (YP_612389.1) is unlikely to have the same function as structurally similar proteins: 2eay, 1wnl, and 1bia.   PDB  3bfm
 225   377904   FM11607A   YP_612366.1   Silicibacter sp. TM1040   putative fructose transport system kinase   PDB  3c8u
 226   383406   FP8022C   YP_612324.1   Silicibacter sp. TM1040   Hypothetical protein with detectable structural similarity to concanavalin A-like lectins/glucanases.   PDB  3oru
3siy
 227   375176   HP10622L   YP_614688.1   Silicibacter sp. TM1040   succinylglutamate desuccinalase   PDB  3na6
 228   391384   MG14561D   YP_611791.1   Silicibacter sp. TM1040   Putative polyketide cyclase. Analysis of genomic neighborhood and phylogenetic profiles indicate that this protein may be functionally associated with nitrilases that break carbon-nitrogen bonds.   PDB  3f8h
 229   391382   MG14585B   YP_614685.1   Silicibacter sp. TM1040   Putative PLP-dependent aminotransferase.   PDB  3fcr
 230   394535   MH10810A   YP_611885.1   Silicibacter sp. TM1040   TenA family transcription regulator [TENA/THI-4]   PDB  3mvu
 231   397279   MI15740X   YP_611455.1   Silicibacter sp. TM1040   Putative aromatic-ring hydroxylating dioxygenase [with two scop folds: ISP domain & Ring hydroxylating alpha subunit catalytic domain]   PDB  3n0q
 232   398828   MI15778A   YP_611946.1   Silicibacter sp. TM1040   putative ICLR transcriptional regulator   PDB  3r4k
 233   371681   FK9665C   YP_001095880.1   Shewanella sp. PV-4   Thioesterase superfamily protein   PDB  2prx
 234   377869   FM11578A   YP_001094981.1   Shewanella sp. PV-4   DJ-1/PfpI-like protein without a conserved catalytic triad.   PDB  3bhn
 235   378300   FM11984A   YP_001095275.1   Shewanella sp. PV-4   putative monooxygenase   PDB  2ril
 236   379941   FN9673C   YP_001095692.1   Shewanella sp. PV-4   Transcriptional regulator, tetR family [Tetracyclin repressor-like, N-terminal domain]   PDB  3gzi
 237   394125   MH11753F   YP_001095400.1   Shewanella sp. PV-4   CheC-like protein   PDB  3iic
 238   394242   MH7306G   YP_001092907.1   Shewanella sp. PV-4   Putative riboflavin biosynthesis protein   PDB  3ky8
 239   399313   MI9673BF   YP_001095229.1   Shewanella sp. PV-4   putative tetR family transcription regulator [DNA/RNA-binding 3-helical bundle, Tetracyclin repressor-like]   PDB  3ppb
 240   361143   PC07369B   YP_001095851.1   Shewanella sp. PV-4   Protein of unknown function from the DUF1488 family with a new fold and possibly involved in signaling through interaction with a phosphorylated ligand.   PDB  2gpi
 241   380289   PC08000B   YP_001092950.1   Shewanella sp. PV-4   Protein of Unknown Function (DUF1696) with Pleckstrin-homology Domains   PDB  3dcx
 242   372337   PG9822C   YP_001095227.1   Shewanella sp. PV-4   DUF3478 protein with a SpoIIaa-like fold. Possibly involved in signalling.   PDB  2q3l
 243   374407   PJ06155C   YP_001092504.1   Shewanella sp. PV-4   shew_20dec04_Contig157_revised_gene3220   PDB  2l6n
 244   406214   TT6839B   YP_001093860.1   Shewanella sp. PV-4   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF1425 family.   PDB  3o0l
 245   391773   29837497   29837497   SARS-Tor2   SARS-CoV non-structural protein   PDB  2jze
2jzd
 246   388820   29837497   29837497   SARS-Tor2   SARS-CoV non-structural protein   PDB  2jwj
2jzf
2jwi
2rnk
 247   355891   SARS024   29837497   SARS-Tor2   SARS-CoV non-structural protein   PDB  2idy
2gri
 248   355937   SARS070   29837500   SARS-Tor2   nonstructural Protein 7   PDB  2kys
1ysy
 249   367631   SARS166   29837497   SARS-Tor2   SARS-CoV non-structural protein   PDB  2acf
 250   367632   SARS167   NP_828860.2   SARS coronavirus   Nonstructural protein 1 (nsp1) from SARS coronavirus   PDB  2hsx
2gdt
 251   396981   SARS168   NP_828850.1   SARS coronavirus   SARS protein, putative RNA binding protein.   PDB  2k87
 252   399745   SARS169   NP_828850.1   SARS coronavirus   SARS protein, putative RNA binding protein.   PDB  2kaf
 253   416489   SARS169   NP_828850.1   SARS coronavirus   SARS protein, putative RNA binding protein.   PDB  2kqw
2kqv
 254   380043   FN12456A   SWOL_07JAN05_CONTIG119_REVISED_GENE619   S. wolfei str. Goettingen   FMN-binding protein   PDB  3in6
 255   391895   FR15089A   YP_753395.1   S. wolfei str. Goettingen   Putative antitoxin part of the bacterial toxin/antitoxin network [two domains: TTHA0281-like & YefM-like]   PDB  3k6q
 256   399241   MI9673AQ   YP_752756.1   S. wolfei str. Goettingen   Putative TetR-family transcriptional regulator   PDB  3lwj
 257   381737   PU9842C   YP_755085.1   S. wolfei str. Goettingen   Putative sulfurtransferase dsrE [DsrEF-like]   PDB  3pnx
 258   359588   16420133   16420133   S. typhimurium   putative methyltransferase [S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase]   PDB  2i6g
 259   358650   16423107   16423107   S. typhimurium   Putative glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase.   PDB  2a3n
 260   371240   FK9279A   NP_463296.1   S. typhimurium   putative xylose isomerase-like protein   PDB  2q02
 261   391508   MG10938D   NP_459564.1   S. typhimurium   Putative phosphosugar isomerase. It is functionally associated with enzymes from the fructose and mannose metabolism.   PDB  3fkj
 262   391498   MG11417G   NP_462565.1   S. typhimurium   Valine-pyruvate aminotransferase AvtA.   PDB  3g7q
 263   391509   MG14656A   NP_459565.1   S. typhimurium   Putative phospho-sugar binding protein [SIS-domain]   PDB  3knz
 264   374979   PC06249B   16421009   S. typhimurium   Ethanolamine utilization protein eutQ   PDB  2pyt
 265   373908   PC06845C   16422983   S. typhimurium   Uncharacterized IolB-like protein   PDB  2qjv
 266   367043   FG7459A   SSUI_28JUL04_CONTIG203_REVISED_GENE585   S. suis 89-1591   Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related   PDB  2hhz
 267   371505   FK4430A   YP_001201006.1   S. suis 89-1591   ADP-ribose pyrophosphatase   PDB  3o8s
 268   378153   FM11809A   SSUI_28JUL04_CONTIG175_REVISED_GENE346   S. suis 89-1591   Putative multiple antibiotic-resistance repressor (MarR).   PDB  3bdd
 269   380027   FN12429A   SSUI_28JUL04_CONTIG259_REVISED_GENE1367   S. suis 89-1591   GCN5-related N-acetyltransferase-like protein (ZP_00874857). This protein is encoded in the conserved genomic neighborhood of Holliday junction DNA helicase RuvB.   PDB  3g3s
 270   391485   MG14575E   SSUI_28JUL04_CONTIG216_REVISED_GENE695   S. suis 89-1591   PLP-dependent aminotransferase, lysine covalently bound to PLP.   PDB  3p6k
3op7
 271   359645   13814777   13814777   S. solfataricus   Archaeal ATPase from PFAM family PF01637   PDB  2fna
 272   359654   13815598   13815598   S. solfataricus   Putative thioesterase   PDB  2gf6
 273   358101   13815834   13815834   S. solfataricus   Proteins that adopts a YbjQ-like fold with unknown function [YjbQ-like]   PDB  1vph
 274   358109   13816655   13816655   S. solfataricus   MazG nucleotide pyrophosphohydrolase   PDB  1vmg
 275   375699   FL10866A   NP_343859.1   S. solfataricus   putative lipase   PDB  2rau
 276   376189   FL10904A   NP_343586.1   S. solfataricus   Putative TenA-like thiaminase [Heme oxygenase-like]   PDB  2qzc
 277   376473   FL11223A   NP_343093.1   S. solfataricus   putative nucleotidyltransferase   PDB  2rff
 278   380014   FN0829A   NP_344512.1   S. solfataricus   CBS domain-containing protein in complex with AMP.   PDB  3ddj
 279   361217   PC01796D   13815350   S. solfataricus   Rubredoxin-like Zn chelating protein with unknown function from the DUF35 family   PDB  2gnr
3irb
 280   372180   PG9933A   NP_342590.1   S. solfataricus   Putative sulfur oxidation protein belongs to DsrE/DsrF-like family [DsrEF-like].   PDB  2qs7
 281   381769   PU12822A   NP_342589.1   S. solfataricus   DsrE/DsrF-like family protein [DsrEF-like]   PDB  3mc3
 282   399539   MI15954C   NP_268878.1   S. pyogenes   PTS dependent N-acetyl-galactosamine-IIB component [PTS IIb component]   PDB  3p3v
 283   391458   MG14652A   YP_001182657.1   S. putrefaciens CN-32   Putative SnoaL-like polyketide cyclase   PDB  3gzb
 284   361165   PC04954E   YP_001181611.1   S. putrefaciens CN-32   Siderophore-interacting protein   PDB  2gpj
 285   396500   PX6706A   YP_001181608.1   S. putrefaciens CN-32   Putative phosphatase (DUF442), related to JCSG structure 2f46   PDB  3gxh
3gxg
 286   377915   FM11616A   YP_167254.1   S. pomeroyi DSS-3   Putative methyltranferase [Rossman fold]   PDB  3cvo
 287   383110   FP10366A   YP_165628.1   S. pomeroyi DSS-3   Protein of unknown function (DUF1989/COG3665) with complex topology and detectable structural similarity to concanavalin A-like lectins/glucanases.   PDB  3di4
 288   392348   FR15172B   YP_165822.1   S. pomeroyi DSS-3   The gene SPO0562 from Silicibacter pomeroyi dss-3 encodes a protein which is likely a methytransferase.   PDB  3iht
 289   391424   MG0148N   YP_167080.1   S. pomeroyi DSS-3   Putative phosphosugar isomerase. Homolog of glutamine-fructose-6-phosphate transaminases (isomerizing).   PDB  3fj1
 290   391453   MG10808L   YP_165150.1   S. pomeroyi DSS-3   Putative cyclic nucleotide-binding protein.   PDB  3h3z
 291   391435   MG14518G   YP_168589.1   S. pomeroyi DSS-3   Uncharacterized protein conserved in bacteria with a cystatin-like fold.   PDB  3flj
 292   391417   MG14647A   YP_166335.1   S. pomeroyi DSS-3   NTF-2 like protein of unknown function. This protein is encoded in the genomic neighborhood of a choline sulfatase [betC-1].   PDB  3fka
 293   391426   MG14649A   YP_167536.1   S. pomeroyi DSS-3   Putative antibiotic biosynthesis monooxygenase [Dimeric alpha+beta barrel]   PDB  3fgv
 294   391429   MG6567B   YP_168127.1   S. pomeroyi DSS-3   sugar phosphate isomerase from a cupin superfamily SPO2919 from Silicibacter pomeroy   PDB  3i7d
 295   394627   MH7542A   YP_165505.1   S. pomeroyi DSS-3   Putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase   PDB  3l12
 296   374753   PJ05853H   YP_164873.1   S. pomeroyi DSS-3   Protein of unknown function [TIM beta/alpha-barrel] that belongs to DUF849 family.   PDB  3chv
 297   374584   PJ06684A   YP_166079.1   S. pomeroyi DSS-3   Bacterial protein from DUF1185 with a chorismate mutase-like fold and sequence homology to a peptide synthase   PDB  2qtp
 298   374660   PJ06938A   YP_165412.1   S. pomeroyi DSS-3   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF1285 family   PDB  2re3
 299   358040   14972639   NP_345629.1   S. pneumoniae TIGR4   putative lipoate-protein ligase A [Class II aaRS and biotin synthetases, SufE/NifU]   PDB  1vqz
 300   391414   MG14470E   NP_344614.1   S. pneumoniae TIGR4   putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase   PDB  3i0z
 301   358603   NP_344555.1   NP_344555.1   S. pneumoniae TIGR4   DNA polymerase III, beta chain (EC 2.7.7.7).   PDB  2awa
 302   359637   NP_346487.1   NP_346487.1   S. pneumoniae TIGR4   Hydrolase from haloacid dehalogenase-like family   PDB  2go7
 303   366227   PD01933D   NP_346012.1   S. pneumoniae TIGR4   Putative 2-phospho-(L)-lactate transferase [alpha/beta class]   PDB  2q7x
 304   374659   PJ06042C   NP_344798.1   S. pneumoniae TIGR4   gi|15900194|ref|NP_344798.1| conserved hypothetical protein [Streptococcus pneumoniae TIGR4]   PDB  2la3
 305   389882   PK10409D   NP_345429.1   S. pneumoniae TIGR4   Multidomain protein with S1 RNA-binding domains and winged helix DNA binding domain.   PDB  3go5
 306   358745   NP_358222.1   NP_358222.1   S. pneumoniae R6   Putative transcriptional regulator from TenA family   PDB  2a6b
 307   371708   FK9452E   NP_717567.1   S. oneidensis   Putative endoribonuclease [Bacillus chorismate mutase-like]   PDB  2otm
 308   378232   FM11876A   NP_715767.1   S. oneidensis   NTF-2 like protein of unknown function [NTF2-like]   PDB  3b7c
 309   379975   FN10833A   NP_718593.1   S. oneidensis   IroE-like serine hydrolase   PDB  3gff
 310   394266   MH0298L   NP_718042.1   S. oneidensis   The gene NP_718042.1 from Shewanella oneidensis likely encodes an apo-form of a NADP reductase.   PDB  3goh
 311   394170   MH11753G   NP_719446.1   S. oneidensis   Putative CheC-like protein involved in bacterial chemotaxis   PDB  3h2d
 312   398694   MI15887P   NP_718175.1   S. oneidensis   Putative oxygenase [Double-stranded beta-helix]   PDB  3on7
 313   365930   PC04170E   NP_718719.1   S. oneidensis   Putative lipoprotein   PDB  3lhn
 314   360890   PC04261E   NP_716371.1   S. oneidensis   putative dye-decolorizing peroxidase [Ferredoxin-like]   PDB  2iiz
2hag
 315   366232   PD01865F   NP_719307.1   S. oneidensis   Putative PhoU-like phosphate regulatory protein from DUF47 family   PDB  2olt
2iiu
 316   372361   PG9878A   NP_717203.1   S. oneidensis   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF3224 family.   PDB  2ooj
 317   376495   PJ02661S   NP_719793.1   S. oneidensis   Fic (Filamentation Induced by cAMP) family protein SO4266.   PDB  2qc0
3eqx
 318   358002   24377463   SMU.1085   S. mutans   Peptide chain release factor 1 (RF-1).   PDB  1zbt
 319   390321   GS13262A   NP_721579.1   S. mutans   Putative beta-lactamase inhibitor protein.   PDB  3d4e
 320   394846   MG0383U   NP_720799.1   S. mutans   Nitroreductase-like protein [FMN-dependent nitroreductase-like]   PDB  3gag
 321   403543   MJ10610B   NP_435675.1   S. meliloti 1021   Hypothetical oxidoreductase   PDB  3rh7
 322   403636   MJ9307D   NP_384335.1   S. meliloti 1021   histidine triad (HIT) protein   PDB  3nrd
 323   403584   MJ9481B   NP_384228.1   S. meliloti 1021   sugar isomerase   PDB  3qc0
 324   405915   TT1668C   NP_385823.1   S. meliloti 1021   a putative transcription regulator   PDB  3pjy
 325   375055   FB10613B   YP_750721.1   S. frigidimarina NCIMB 400   Putative flavin reductase with split barrel domain. It may be part of a two-component enzyme system, composed of a flavin reductase and an oxidase, which uses the reduced flavin to hydroxylate substrates.   PDB  3fge
 326   387127   FK6177B   YP_752209.1   S. frigidimarina NCIMB 400   Domain of Unknown Function with a Cupin Fold   PDB  3d82
 327   371790   FK9784A   YP_751781.1   S. frigidimarina NCIMB 400   Protein from the superfamily of RmlC-like cupins (Double-stranded beta-helix fold)   PDB  2pfw
 328   378123   FM11786A   YP_750657.1   S. frigidimarina NCIMB 400   Genomic neighborhood of the putative ketosteroid isomerase (YP_750657.1) is enriched in genes encoding proteins involved in copper resistance.   PDB  3bb9
 329   375169   HP10632F   YP_749235.1   S. frigidimarina NCIMB 400   Putative succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase   PDB  3lwu
 330   372476   PG9822D   YP_749275.1   S. frigidimarina NCIMB 400   Bacterial protein from DUF3478; putative role as universal stress protein   PDB  2ook
 331   374311   PJ04820A   YP_750003.1   S. frigidimarina NCIMB 400   tryptophan halogenase   PDB  2pyx
 332   381550   PU8575B   YP_751971.1   S. frigidimarina NCIMB 400   Putative hydrolase   PDB  3lho
 333   376319   FL11068A   NP_764060.1   S. epidermidis ATCC 12228   Deoxyribonucleotidase-like protein is also similar to histidinol phosphatase. The predicted catalytic residues: Asp9 and Asp11. Genomic neighborhood and phylogenetic cooccurrence indicate functional association with choline transport, histidine metabolism and nitric-oxide synthesis.   PDB  3bwv
 334   391352   MG0383T   NP_765521.1   S. epidermidis ATCC 12228   Putative NAD(P)H:FMN oxidoreductase [FMN-dependent nitroreductase-like]   PDB  3gbh
 335   394358   MH10870A   NP_765248.1   S. epidermidis ATCC 12228   putative thiaminase II   PDB  3no6
 336   366230   PD01933E   NP_764104.1   S. epidermidis ATCC 12228   Putative phosphotransferase   PDB  2ppv
 337   370140   FJ9110A   YP_564736.1   S. denitrificans OS-217   Domain of Unknown Function with a Heme Oxygenase-like Fold   PDB  3dde
 338   375163   HP10629G   YP_562911.1   S. denitrificans OS-217   Putative carboxypeptidase A   PDB  3l2n
 339   375165   HP10645E   YP_563529.1   S. denitrificans OS-217   Carboxypeptidases, desuccinylases, aspartoacylases and uncharacterized protein YP_563529.1 are similar to each other and belong to metallopeptidases containing co-catalytic metalloactive sites.   PDB  3b2y
 340   391339   MG0148K   YP_563707.1   S. denitrificans OS-217   Putative phosphosugar isomerase (SIS domain fold)   PDB  3hba
 341   394060   MH0111B   YP_563138.1   S. denitrificans OS-217   Hypothetical alcohol dehydrogenase   PDB  3rf7
 342   368328   PE00238G   YP_561575.1   S. denitrificans OS-217   DNA damage-inducible protein from the DinB family   PDB  2oqm
 343   372600   PG9969A   YP_563039.1   S. denitrificans OS-217   Bacterial protein from DUF3224 with an AOC barrel-like fold   PDB  2q03
 344   396443   PX14652B   SDEN_20JUL04_CONTIG92_REVISED_GENE3346   S. denitrificans OS-217   Putative SnoaL-like polyketide cyclase   PDB  3lza
 345   354901   YDR428C   YDR428C   S. cerevisiae   Putative serine hydrolase, D9461.15P.   PDB  1vkh
 346   354980   YEL038W   YEL038W   S. cerevisiae   UTR4 protein (Unknown transcript 4 protein).   PDB  2g80
 347   355004   YFR010W   YFR010W   S. cerevisiae   Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6 (EC 3.1.2.15) (Ubiquitin thiolesterase 6) (Ubiquitin-specific processing protease 6) (Deubiquitinating enzyme 6).   PDB  1vjv
 348   355059   YIR029W   YIR029W   S. cerevisiae   Allantoicase (EC 3.5.3.4) (Allantoate amidinohydrolase).   PDB  1o59
 349   354135   YOR209C   YOR209C   S. cerevisiae   Putative nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase).   PDB  1vlp
 350   354122   YOR323C   YOR323C   S. cerevisiae   Gamma-glutamyl phosphate reductase (GPR) (EC 1.2.1.41) (Glutamate-5- semialdehyde dehydrogenase) (Glutamyl-gamma-semialdehyde dehydrogenase) (GSA dehydrogenase).   PDB  1vlu
 351   375054   FB10609B   YP_001049024.1   S. baltica OS155   FMN-binding domain of a flavin reductase-like enzyme [Split barrel-like]   PDB  3hmz
 352   378217   FM11862A   YP_001049020.1   S. baltica OS155   NTF2-like protein of unknown function.   PDB  3blz
 353   378293   FM11978A   YP_001048502.1   S. baltica OS155   Putative PII-like nitrogen regulatory protein   PDB  3ce8
 354   383464   FP4102A   YP_001051978.1   S. baltica OS155   Putative oxygenase.   PDB  3dkq
 355   375157   HP10645C   YP_001051774.1   S. baltica OS155   Putative Zn-peptidase   PDB  3ieh
 356   398981   MI4130F   YP_001050605.1   S. baltica OS155   6-phosphogluconolactonase   PDB  3nwp
 357   380281   PC06938B   YP_001050848.1   S. baltica OS155   Protein from DUF1285 with a PH-like fold   PDB  2ra9
 358   374572   PJ04222C   YP_001051499.1   S. baltica OS155   Protein of unknown function from DUF416   PDB  2q9r
 359   367003   FG7419A   NP_828636.1   S. avermitilis MA-4680   protein with FMN-binding split barrel fold   PDB  2iab
 360   378018   FM11705A   NP_825848.1   S. avermitilis MA-4680   Putative dehydratase from the NTF2-like family   PDB  3cnx
 361   379891   FN9673K   NP_821317.1   S. avermitilis MA-4680   Putative TetR-transcriptional regulator [multidomain all alpha protein]   PDB  3jsj
 362   381519   PU6739A   NP_823353.1   S. avermitilis MA-4680   Rossmann-fold protein of unknown function (DUF574)[S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases].   PDB  3go4
3giw
 363   378017   FM11704A   NP_371943.1   S. aureus Mu50   Putative acetyltransferase (acyl-CoA N-acyltransferase fold)   PDB  3h4q
 364   379875   FN9546A   NP_373092.1   S. aureus Mu50   Acetyltransferase of GNAT family, where Tyr129 is predicted as the catalytic residue.   PDB  3d8p
 365   382610   FP10572B   NP_373108.1   S. aureus Mu50   Flavin-containing putative monooxygenase (FAD/NAD(P)-binding domain fold)   PDB  3d1c
 366   375153   HP2219D   NP_372036.1   S. aureus Mu50   Tripeptidase   PDB  3rza
 367   399559   MI15962B   NP_372959.1   S. aureus Mu50   Putative bacterial transcription activator   PDB  3lur
 368   417440   SP17980D   NP_370957.1   S. aureus Mu50   superantigen-like protein   PDB  3o13
 369   417464   SP18127A   NP_370827.1   S. aureus Mu50   hypothetical protein, PF14729 (DUF4467) secreted protein     4ebg
 370   358652   NP_645455.1   NP_645455.1   S. aureus MW2   putative acetyltransferase from GNAT family   PDB  2aj6
 371   374925   NP_646154.1   NP_646154.1   S. aureus MW2   Bacterial domain of unknown function (DUF1798) [four-helical bundle fold]   PDB  2ets
 372   400661   FR14737F   YP_928783.1   S. amazonensis SB2B   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF2131 family ["Winged helix" DNA-binding domain].   PDB  3ke2
 373   375151   HP10632E   YP_926482.1   S. amazonensis SB2B   Putative succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase.   PDB  3fmc
 374   375152   HP10645A   YP_926603.1   S. amazonensis SB2B   Putative metallopeptidase   PDB  2qvp
 375   394107   MH7531D   YP_929327.1   S. amazonensis SB2B   Putative phosphohydrolase   PDB  3m1t
 376   394288   MH7544A   YP_926882.1   S. amazonensis SB2B   Putative metal-dependent phosphohydrolase   PDB  3i7a
 377   398935   MI15755X   YP_929127.1   S. amazonensis SB2B   UROPORPHYRINOGEN-III SYNTHASE [HemD-like]   PDB  3mw8
 378   399142   MI9673AA   YP_925981.1   S. amazonensis SB2B   Hypothetical TetR-like transcriptional regulator   PDB  3rh2
 379   378832   NT12250A   SAMA_14OCT04_CONTIG53_REVISED_GENE1514   S. amazonensis SB2B   Putative DNA replication regulator Hda is likely to be a CTPase.   PDB  3bos
 380   396931   NT12250A   SAMA_14OCT04_CONTIG53_REVISED_GENE1514   S. amazonensis SB2B   Putative DNA replication regulator Hda is likely to be a CTPase.   PDB  3sc3
 381   373751   PH10070D   YP_928494.1   S. amazonensis SB2B   Sama_2622 adopting a new all alpha fold; putative ferritin-like protein   PDB  2pv4
 382   373679   PH10197A   YP_926445.1   S. amazonensis SB2B   sama_14oct04_Contig100_revised_gene22   PDB  2l6o
 383   381783   PU6399C   YP_926556.1   S. amazonensis SB2B   Bacterial pleckstrin homology domain   PDB  3hsa
 384   396409   PX8928B   YP_926796.1   S. amazonensis SB2B   Peptidase M28 precursor.   PDB  3iib
 385   370306   FJ1648A   NP_688652.1   S. agalactiae 2603   putative metal dependent phosphohydrolase   PDB  2ogi
 386   370427   FJ9546A   NP_689019.1   S. agalactiae 2603   acetyltransferase   PDB  2q7b
 387   371586   FK9742A   NP_688560.1   S. agalactiae 2603   acetyltransferase GNAT family   PDB  2pc1
 388   379820   FN9768A   YP_461911.1   S. aciditrophicus SB   Putative thioesterase (thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase fold)   PDB  3hdu
 389   383639   FP7651A   YP_460196.1   S. aciditrophicus SB   Putative tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit E (FmdE) [FwdE/GAPDH domain-like]   PDB  3d00
 390   392645   FR14824A   YP_461806.1   S. aciditrophicus SB   Putative molybdenum carrier protein [MCP/YpsA-like]   PDB  3imk
 391   399109   MI9663A   YP_461098.1   S. aciditrophicus SB   Putative transcriptional regulator of the TetR family   PDB  3s5r
 392   416854   SP0409AA   ZP_02041710.1   Ruminococcus gnavus ATCC 29149   putative glycyl-glycine endopeptidase lytM   PDB  3nyy
 393   416850   SP1554B   ZP_02041731.1   Ruminococcus gnavus ATCC 29149   hypothetical protein RUMGNA_02503, protein of PF07009 family, DUF1312     4esn
 394   417407   SP17946A   ZP_02040092.1   Ruminococcus gnavus ATCC 29149   putative metal binding protein RUMGNA_00854, homologous to the "lid domain" of gastric intrinsic factor, i.e. C-terminal domains of 2PMV and 2BB6 protein which bind cobalamin.   PDB  3u7z
 395   417426   SP17965A   ZP_02040151.1   Ruminococcus gnavus ATCC 29149   putative peptide binding protein   PDB  3noh
 396   403422   MJ14530B   YP_354942.1   Rhodobacter sphaeroides 2.4.1   aspartate aminotransferase   PDB  3nra
 397   376596   PS04248   YP_001042567.1   R. sphaeroides atcc 17029   Protein of unknown function (DUF427)   PDB  3djm
 398   370502   FJ5490A   YP_425393.1   R. rubrum ATCC 11170   Alkylhydroperoxidase AhpD core   PDB  2ouw
 399   378192   FM11842A   YP_427473.1   R. rubrum ATCC 11170   NTF2-like protein of unknown function in nutrient uptake.   PDB  3fsd
 400   379808   FN9673I   YP_425770.1   R. rubrum ATCC 11170   Transcriptional regulator of TetR family (YP_425770) and proteins with putative antimicrobial activity are encoded by neighboring genes.   PDB  3cwr
 401   383760   FP6436A   YP_428290.1   R. rubrum ATCC 11170   An alpha-helical protein of unknown function (Pfam01724). It is in genomic neighborhood of rnhB (Ribonuclease HII).   PDB  3fcn
 402   391960   FR15129A   YP_427503.1   R. rubrum ATCC 11170   Protein with unknown function from DUF3532 family   PDB  3k8r
 403   394507   MH15467A   YP_426450.1   R. rubrum ATCC 11170   rrub_10jan05_Contig98_revised_gene1303   PDB  3qxb
 404   403519   MJ15949E   NP_949368.1   R. palustris CGA009   formyltetrahydrofolate deformylase   PDB  3obi
 405   403484   MJ3134L   NP_946427.1   R. palustris CGA009   Putative dehydrogenase [FAD-binding/transporter-associated domain-like, Ferredoxin-like]   PDB  3pm9
 406   403456   MJ3193C   NP_947670.1   R. palustris CGA009   putative acetylornithine deacetylase [Phosphorylase/hydrolase-like]   PDB  3pfo
 407   405167   TT16411A   NP_949733.1   R. palustris CGA009   ABC-type branched-chain amino acid transporter   PDB  3n0x
 408   403814   PT06249A   YP_766765.1   R. leguminosarum bv. viciae 3841   EutQ-like protein with a cupin fold   PDB  3lwc
 409   387040   EK5976M   YP_295230.1   R. eutropha JMP134   Putative aminoglycoside phosphotransferase.   PDB  3dxp
 410   366988   FG7406A   YP_295714.1   R. eutropha JMP134   putative 4-methylmuconolactone methylisomerase   PDB  2ifx
 411   380353   FG7408A   YP_298765.1   R. eutropha JMP134   Protein with a cupin-like fold and unknown function.   PDB  3cjx
 412   381874   FG7410A   YP_299883.1   R. eutropha JMP134   EthD-like protein [Ferredoxin-like]   PDB  3bf4
 413   370263   FJ5490C   YP_296737.1   R. eutropha JMP134   alkylhydroperoxidase AhpD core: uncharacterized peroxidase-related protein   PDB  2prr
 414   370563   FJ8891A   YP_298295.1   R. eutropha JMP134   Putative transcriptional regulator/DNA-binding protein   PDB  2obp
 415   370429   FJ9548A   YP_298971.1   R. eutropha JMP134   Putative thioesterase, phenylacetic acid degradation-related protein [PaaI/YdiI-like].   PDB  2pim
 416   371684   FK5955B   YP_294607.1   R. eutropha JMP134   RmlC-like cupin with unknown function   PDB  3ebr
 417   371710   FK8801A   YP_295895.1   R. eutropha JMP134   GCN5-related N-acetyltransferase   PDB  2q0y
 418   371797   FK8817C   YP_295660.1   R. eutropha JMP134   Putative mannose-6-phosphate isomerase   PDB  2opk
 419   376637   FL11003A   YP_299159.1   R. eutropha JMP134   The gene Reut_B4967 from Ralstonia eutropha jmp134 encodes a putative ketopantonoate reductase   PDB  3hwr
 420   377866   FM11573B   YP_295234.1   R. eutropha JMP134   Putative glutathione S-transferase [Thioredoxin, GST C-terminal domain-like]   PDB  3cbu
 421   377390   FM12049A   YP_299179.1   R. eutropha JMP134   Putative glycosyl hydrolase with BNR repeat [7-bladed beta-propeller]   PDB  3b7f
 422   379793   FN7456B   YP_296387.1   R. eutropha JMP134   Thioesterase [Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase fold]   PDB  3ck1
 423   383474   FP9641B   YP_298823.1   R. eutropha JMP134   Putative transcriptional regulator GntR   PDB  3ihu
 424   391227   MG14503Q   YP_297314.1   R. eutropha JMP134   Histidinol-phosphate aminotransferase.   PDB  3euc
 425   391247   MG14627A   YP_298287.1   R. eutropha JMP134   Putative biosynthetic protein with RmlC-like cupin fold.   PDB  3fjs
 426   391221   MG8761L   YP_295443.1   R. eutropha JMP134   The sequence YP_295443.1 from Ralstonia eutropha jmp134 corresponds to an enzyme from a family of nitroreductases.   PDB  3hj9
 427   394240   MH10766D   YP_296108.1   R. eutropha JMP134   The gene ID YP_296108.1 from Ralstonia eutropha jmp134 encodes a putative NADPH:quinone oxidoreductase.   PDB  3iup
 428   394332   MH10855A   YP_298327.1   R. eutropha JMP134   Fe-dependent alcohol dehydrogenase [two domains: Rossman-like and all alpha class]   PDB  3jzd
 429   397820   MI12113D   YP_298346.1   R. eutropha JMP134   Hypothetical lyase   PDB  3qqw
 430   360840   PC05853B   YP_295841.1   R. eutropha JMP134   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF849 family.   PDB  3no5
 431   361076   PC05995D   YP_299237.1   R. eutropha JMP134   Putative cysteine dioxygenase type I   PDB  2gm6
 432   374214   PJ05013D   YP_297560.1   R. eutropha JMP134   N-formylglutamate amidohydrolase (phosphorylase/hydrolase-like fold)   PDB  2q7s
 433   389767   PK6406E   YP_297411.1   R. eutropha JMP134   Phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaB   PDB  3egr
 434   381418   PU6423S   YP_293392.1   R. eutropha JMP134   Putative 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme from DUF849 (PF05853) [TIM beta/alpha-barrel]   PDB  3c6c
 435   381263   PU8575A   YP_299723.1   R. eutropha JMP134   The sequence YP_299723.1 from Ralstonia eutropha jmp134 encodes a putative metal hydrolase.   PDB  3iuz
 436   396389   PX15607B   YP_299413.1   R. eutropha JMP134   Putative DNA-binding protein from DUF296.   PDB  3hwu
 437   403252   MJ11245A   NP_791563.1   Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000   TenA homolog   PDB  3oql
 438   403356   MJ15949D   NP_794070.1   Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000   formyltetrahydrofolate deformylase   PDB  3o1l
 439   403325   MJ16247B   NP_790095.1   Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF861 family [YlbA-like].   PDB  3myx
 440   391203   MG14622A   YP_291699.1   Prochlorococcus sp. NATL2A   NTF2-like protein of unknown function from Prochlorococcus marinus   PDB  3hzp
 441   368256   PE00037D   PROC_21JUN05_CONTIG39_REVISED_GENEPMN12A0962   Prochlorococcus sp. NATL2A   Protein of unknown function from DUF1818 family with a ssDNA-binding transcriptional regulator domain fold   PDB  2it9
 442   419184   SP13677A   ZP_02032405.1   Parabacteroides merdae   Putative trehalose, ThuA like proteins, trehalose utilisation   PDB  4e5v
 443   419245   SP18803A   ZP_02033194.1   Parabacteroides merdae   hypothetical protein, PF14725 family protein, DUF4466     4ei0
 444   419155   SP5111E   ZP_02030115.1   Parabacteroides merdae   clostripain from Parabacteroides merdae     3uws
 445   393086   GS0207A   YP_001302908.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative metal-dependent hydrolase.   PDB  3kl7
 446   393088   GS10633B   YP_001304870.1   P.distasonis ATCC 8503   Hypothetical Zn-dependent exopeptidase   PDB  3tc8
 447   393092   GS1225C   YP_001304469.1   P.distasonis ATCC 8503   Hypothetical glycoside hydrolase   PDB  3taw
 448   394678   GS12873A   YP_001303944.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative iron-regulated protein A precursor, putative metalloendopeptidase, cytoplasmic membrane protein, Imelysin-like protein   PDB  4ecg
 449   394691   GS13193E   YP_001303332.1   P.distasonis ATCC 8503   Hypothetical PERIPLASMIC PROTEIN   PDB  3u1w
 450   394722   GS13419B   YP_001303978.1   P.distasonis ATCC 8503   Unknown function [2 domains: beta barrel, beta sandwich]   PDB  3k0y
 451   394726   GS13471D   YP_001303602.1   P.distasonis ATCC 8503   cysteine protease   PDB  3pw3
 452   394744   GS13561A   YP_001304622.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative glycoside hydrolase.   PDB  3gyc
 453   385935   GS13562A   YP_001303366.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative ketosteroid isomerase [cystatin-like]   PDB  3ke7
 454   394748   GS13565A   YP_001304447.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative glycoside hydrolase/deacetylase highly overrepresented in gut microbes.   PDB  3lm3
 455   394752   GS13641A   YP_001302580.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative glycosyl hydrolase from the DUF1080   PDB  3hbk
 456   394755   GS13645A   YP_001304206.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative sugar hydrolase (concanavalin A-like lectins/glucanases fold)   PDB  3h3l
 457   394756   GS13646A   YP_001303226.1   P.distasonis ATCC 8503   member of the DUF1080 family, part of concavalin clan of glycosyl hydrolases   PDB  3u1x
 458   394767   GS13660A   YP_001303815.1   P.distasonis ATCC 8503   Hypothetical Glycosyl hydrolase   PDB  3s5q
 459   394774   GS13686A   YP_001301998.1   P.distasonis ATCC 8503   SusD homolog [alpha-alpha superhelix]   PDB  3p1u
 460   394781   GS13721A   YP_001304412.1   P.distasonis ATCC 8503   DUF2807 with a structure related to the pectin lyase-like family   PDB  3lyc
 461   394782   GS13725A   YP_001304413.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative acetyltransferase   PDB  3ljy
 462   386057   GS13813A   YP_001304840.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative cell adhesion protein   PDB  3liu
 463   385843   GS13818A   YP_001301887.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative glycosyl hydrolase [concanavalin A-like lectins/glucanases]   PDB  3imm
 464   394796   GS13857A   YP_001304415.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative lipoprotein.   PDB  3jx8
 465   394807   GS13941A   YP_001302749.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative ABC transporter periplasmic binding protein [Phosphate binding protein-like].   PDB  3hn0
 466   394811   GS14016A   YP_001302112.1   P.distasonis ATCC 8503   GS14016A   PDB  2lg7
2lge
 467   394815   GS14054A   YP_001304845.1   P.distasonis ATCC 8503   hypothetical fimbrial assembly protein   PDB  3r4r
 468   394828   GS8421A   YP_001302526.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative protease [multidomain alpha+beta class]   PDB  3kd4
 469   394435   MH10719A   YP_001303454.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase [two scop folds: PurM N-terminal domain-like & PurM C-terminal domain-like]   PDB  3mdo
 470   400675   MH1224A   YP_001303002.1   P.distasonis ATCC 8503   Glucokinase [Glucokinase from scop]   PDB  3mcp
 471   396612   PX0383C   YP_001303097.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase.   PDB  3m5k
 472   396647   PX0416A   YP_001305149.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative uncharacterized protein.   PDB  3kws
 473   396627   PX14343H   YP_001305260.1   P.distasonis ATCC 8503   SusD superfamily protein. Putative outer membrane protein, probably involved in nutrient binding.   PDB  3otn
 474   396614   PX15447B   YP_001303260.1   P.distasonis ATCC 8503   Sugar phosphate isomerase/epimerase [TIM beta/alpha-barrel]   PDB  3p6l
 475   396625   PX15447C   YP_001305105.1   P.distasonis ATCC 8503   Putative sugar isomerase   PDB  3lmz
 476   396626   PX4068D   YP_001305224.1   P.distasonis ATCC 8503   Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase.   PDB  3mz2
 477   396624   PX7607B   YP_001301802.1   P.distasonis ATCC 8503   glycerophosphodiester phosphodiesterase.   PDB  3no3
 478   396634   PX9615C   YP_001303399.1   P.distasonis ATCC 8503   Sugar phosphate isomerase/epimerase.   PDB  3l23
 479   396643   PX9615D   YP_001304724.1   P.distasonis ATCC 8503   sugar phosphate isomerase/epimerase   PDB  3obe
 480   406137   TT4069A   YP_001302366.1   P.distasonis ATCC 8503   GDSL-like Lipase [Flavodoxin-like]   PDB  3p94
 481   405115   TT5110A   YP_001302508.1   P.distasonis ATCC 8503   Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C   PDB  3lwx
 482   366984   FG7402A   NP_742468.1   P. putida KT2440   Putative thioesterase   PDB  2hlj
 483   391191   MG14561C   NP_743055.1   P. putida KT2440   Putative polyketide cyclase.   PDB  3f7x
 484   391198   MG5690C   NP_746665.1   P. putida KT2440   Putative ketosteroid isomerase homolog from the NTF2-like superfamily.   PDB  3f7s
 485   398622   MI15949C   NP_744095.1   P. putida KT2440   N-terminal ACT domain of formyltetrahydrofolate deformylase   PDB  3nrb
 486   398629   MI15949E   NP_742494.1   P. putida KT2440   formyltetrahydrofolate deformylase [contains two domians: ACT-like & Formyltransferase]   PDB  3n0v
 487   360824   PC06175E   NP_744337.1   P. putida KT2440   Putative tRNA-(ms(2)io(6)a)-hydroxylase [MiaE-like]   PDB  2itb
 488   365921   PC07007E   NP_742474.1   P. putida KT2440   Secreted protein of unknown function (DUF1311).   PDB  3gi7
 489   360827   PC07317D   NP_746511.1   P. putida KT2440   PilZ-containing protein   PDB  2gjg
 490   381657   PU4030C   NP_744700.1   P. putida KT2440   Putative SAM Dependent Methyltransferase in Complex with SAH   PDB  3e8s
 491   392698   FR14867A   YP_804159.1   P. pentosaceus ATCC 25745   Hypothetical selenium binding protein   PDB  3qkb
 492   394309   MH6034A   YP_805003.1   P. pentosaceus ATCC 25745   Dihydrofolate reductase[dihydrofolate reductase-like]   PDB  3jtw
 493   366978   FG7396A   NP_895880.1   P. marinus MIT9313   putative 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA hydrolase [Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase]   PDB  2hx5
 494   370119   FJ8786A   NP_895059.1   P. marinus MIT9313   Ferritin-like protein from DUF3066   PDB  2oc5
 495   357888   3258004   3258004   P. horikoshii   Protein of unknown function from DUF89 family.   PDB  2g8l
 496   375048   FB10607B   NP_142786.1   P. horikoshii   FMN-binding protein   PDB  2r6v
 497   370067   FJ6376A   NP_143367.1   P. horikoshii   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF364 family.   PDB  3npg
 498   379751   FN12657A   NP_142035.1   P. horikoshii   Putative Acetyltransferase   PDB  3ddd
 499   391162   MG0383R   NP_904626.1   P. gingivalis W83   Putative NAD(P)H:FMN oxidoreductase.   PDB  3ge5
 500   391161   MG14556B   NP_905498.1   P. gingivalis W83   Putative aspartate aminotransferase. Residues from predicted active site: Asp220, Phe142, and Lys259.   PDB  3g0t
 501   378383   PT05853A   YP_917261.1   P. denitrificans PD1222   Putative 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme from the DUF849 group   PDB  3fa5
 502   424052   YP_916642.1   YP_916642.1   P. denitrificans PD1222   gi|119385587|ref|YP_916642.1| hypothetical protein Pden_2862 [Paracoccus denitrificans PD1222]   PDB  2ll0
 503   380202   FH7490A   YP_263493.1   P. arcticum 273-4   Putative pyridoxamine 5'-phosphate oxidase   PDB  2re7
 504   370504   FJ8839A   YP_263861.1   P. arcticum 273-4   Putative osmotic stress induced and detoxification response OsmC-like protein [OsmC-like fold]   PDB  2pn2
 505   391146   MG11396G   YP_263340.1   P. arcticum 273-4   MUREIN PEPTIDE LIGASE [MurCD N-terminal domain, Ribokinase-like, MurD-like peptide ligases (peptide-binding domain)]   PDB  3hn7
 506   391142   MG11417F   YP_265399.1   P. arcticum 273-4   The gene avtA from Psychrobacter arcticum 273-4 encodes a putative valine-pyruvate aminotransferase.   PDB  3if2
 507   391141   MG3368B   YP_263484.1   P. arcticum 273-4   Serine-pyruvate aminotransferase [PLP-dependent transferase-like]   PDB  3ke3
 508   368209   PE00389E   YP_265345.1   P. arcticum 273-4   protein with a Zn-chelating Sec-C motif [cystatin-like, Sec-C motif]   PDB  2i9w
 509   406062   TT16490A   YP_265084.1   P. arcticum 273-4   Imelysin-like protein   PDB  3pf0
 510   357779   9946807   NP_249596.1   P. aeruginosa   putative carbon storage regulator protein [CsrA-like]   PDB  1vpz
 511   357814   9949912   NP_252433.1   P. aeruginosa   Putative 16S ribosomal RNA processing protein RimM [two folds: RimM N-terminal domain-like & PRC-barrel C-terminal domain-like]   PDB  2f1l
 512   391135   MG14518C   NP_250810.1   P. aeruginosa   STEROID DELTA-ISOMERASE [Ketosteroid isomerase-like]   PDB  3mso
 513   391122   MG9813A   NP_250591.1   P. aeruginosa   Protein PhzB2 with cystatin-like fold and a function related to phenazine biosynthesis.   PDB  3ff0
 514   369551   NP_252042.1   NP_252042.1   P. aeruginosa   Putative flagella synthesis protein flgN   PDB  2fup
 515   361394   PC06155B   NP_253742.1   P. aeruginosa       PDB  2l6p
 516   361385   PC06475C   NP_250684.1   P. aeruginosa   Protein of unknown function from DUF1089 family, possibly involved in glycolipid metabolism with a spiral beta roll fold.   PDB  2h1t
 517   366300   PD04303G   NP_249484.1   P. aeruginosa   Putative methylaconitate isomerase from the PrpF family [PA0793-like].   PDB  2h9f
 518   381648   PU6302B   NP_253966.1   P. aeruginosa   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF484 family [GAF domain].   PDB  3e98
 519   419247   SP16046A   NP_251743.1   P. aeruginosa   probable hydrolytic enzyme, alpha/beta hydrolase fold     4f0j
 520   416819   SP17657A   NP_252301.1   P. aeruginosa   putative secreted protein   PDB  3npd
 521   416836   SP17688A   NP_250297.1   P. aeruginosa   immunoglobulin-like protein from Pseudomonas aeruginosa   PDB  3n6y
 522   416839   SP17692A   NP_250624.1   P. aeruginosa   ApaG protein   PDB  3sb3
3nrf
 523   417258   SP18810A   NP_249547.1   P. aeruginosa   protein with unknown function from DUF2059 family   PDB  3oao
 524   417321   SP18988A   NP_253245.1   P. aeruginosa   fimbrial biogenesis protein PilY2 from Pseudomonas aeruginosa PAO1   PDB  3tdq
 525   417334   SP19004A   NP_249079.1   P. aeruginosa   hypothetical protein with immunoglobulin-like fold   PDB  3uc2
 526   417336   SP19007A   NP_250015.1   P. aeruginosa   putative carbohydrate binding protein [Prealbumin-like]   PDB  3qec
 527   420892   SP19058B   NP_252073.1   P. aeruginosa   SP19058B   PDB  3n5l
 528   417344   SP19119A   NP_253659.1   P. aeruginosa   hypothetical protein, PF11738 family, DUF3298   PDB  4e72
 529   354073   17130350   17130350   Nostoc sp.   Alanine--glyoxylate aminotransferase.   PDB  1vjo
 530   354074   17130499   17130499   Nostoc sp.   Anthranilate phosphoribosyltransferase 2 (EC 2.4.2.18).   PDB  1vqu
 531   356118   17134165   17134165   Nostoc sp.   Putative heme oxygenase of the FMN-binding split barrel superfamily.   PDB  1vl7
 532   354318   17135349   17135349   Nostoc sp.   Putative GDSL-like lipase [SGNH hydrolase]   PDB  1vjg
1z8h
 533   354432   17135470   17135470   Nostoc sp.   Putative fatty acid synthase acyl carrier protein   PDB  2afd
2afe
 534   359702   23130561   23130561   Nostoc punctiforme PCC 73102   Putative ubiquinone biosynthesis protein   PDB  3msq
 535   359701   53686717   53686717   Nostoc punctiforme PCC 73102   Cell associated hydrolase from a NlpC/P60 family. Structural analysis suggests that it is a gamma-D-Glutamyl-L-Diamino acid endopeptidase with murein peptide specificity. Contains an SH3-like fold and a cysteine proteinase fold.   PDB  2fg0
2evr
 536   368884   CM7979A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF5605   Nostoc punctiforme PCC 73102   Putative dioxygenase [Double-stranded beta-helix]   PDB  2qdr
 537   369000   CM8073A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPR4044   Nostoc punctiforme PCC 73102   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF3598 family [All1756-like].   PDB  2o62
 538   367231   FH7484A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF5749   Nostoc punctiforme PCC 73102   Putative pyridoxamine 5'-phosphate oxidase [PNP-oxidase like]   PDB  2i51
 539   367233   FH7486A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPR6570   Nostoc punctiforme PCC 73102   General stress protein of COG3871 belonging to the pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like sequence family and 3D fold.   PDB  2i02
 540   369877   FJ9257A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF0524   Nostoc punctiforme PCC 73102   Putative lactonase of the SMP-30/Gluconolactonase/LRE-like region family   PDB  2p4o
 541   371811   FK9788B   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF2943   Nostoc punctiforme PCC 73102   Putative antidote protein of plasmid maintenance system.   PDB  3cec
 542   375748   FL10945A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPR0239   Nostoc punctiforme PCC 73102   Putative O-methyltransferase with an N-terminal Plant O-methyltransferase domain   PDB  2r3s
 543   377778   FM11503A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF6505   Nostoc punctiforme PCC 73102   CADD-like protein of unknown function. The function of NP_001869710 could be similar to that of CT610 protein from Chlamydia trachomatis.   PDB  3b5p
3b5o
 544   377910   FM11613A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPR1993   Nostoc punctiforme PCC 73102   Domain of Unknown Function with a Cystatin-like Fold.   PDB  3cu3
 545   378141   FM11798A   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPR3134   Nostoc punctiforme PCC 73102   protein of unknown function with a cystatin-like fold   PDB  2rgq
 546   398890   MI15797C   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF1913   Nostoc punctiforme PCC 73102   Creatinine amidohydrolase   PDB  3no4
 547   373118   PD07049G   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF6341   Nostoc punctiforme PCC 73102   Tellurite resistance protein of COG3793   PDB  2ou3
 548   368168   PE00035C   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF2941   Nostoc punctiforme PCC 73102   an XisH family protein   PDB  2inb
 549   368193   PE00035E   NPUN_22DEC03_PLASMIDA_REVISED_GENEPNPAR114   Nostoc punctiforme PCC 73102   XisI-like protein.   PDB  3d7q
 550   374007   PE00092D   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPF1925   Nostoc punctiforme PCC 73102   Putative dioxygenase [Ferredoxin-like fold]   PDB  2peb
 551   381788   PU8365B   NPUN_22DEC03_CONTIG1_REVISED_GENENPR1471   Nostoc punctiforme PCC 73102   FtsZ-like protein of unknown function.   PDB  3c8l
 552   367330   7380613   7380613   N. meningitidis   Putative eukaryotic-like protein phosphatase (fold of phosphotyrosine protein phosphatases II)   PDB  2f46
 553   391072   MG14465E   NP_283882.1   N. meningitidis   Aminotransferase [PLP-dependent transferase-like]   PDB  3jtx
 554   379639   FN12523B   YP_208650.1   N. gonorrhoeae FA 1090   The protein structure of transaldolase (YP_208650.1) is almost identical to transaldolase B from Escherichia coli (PDB code 1onr).   PDB  3clm
 555   389948   FP12834A   YP_208969.1   N. gonorrhoeae FA 1090   Putative regulatory protein involved in transcription from DUF2063; functionally associated with DUF692, DUF560, and DUF452.   PDB  3dee
 556   391948   FR15123A   YP_208451.1   N. gonorrhoeae FA 1090   Unknown function, homolog to human suppressor of fused (sufu) protein [alpha+beta class]   PDB  3k5j
 557   398990   MI4130I   YP_207848.1   N. gonorrhoeae FA 1090   Putative 6-phosphogluctonolactonase   PDB  3lhi
 558   358727   NP_841403.1   NP_841403.1   N. europaea   Putative transcriptional regulator (superfamily and fold of lambda repressor-like DNA-binding domains)   PDB  2a6c
 559   360535   NP_841447.1   NP_841447.1   N. europaea   Putative AttH protein, lipid binding/transport protein [AttH-like fold]   PDB  2ich
 560   371292   FK9613A   YP_496845.1   N. aromaticivorans DSM 12444   putative thioesterase   PDB  3cjy
 561   376212   FL10960A   YP_496351.1   N. aromaticivorans DSM 12444   Putative DNA-binding transcriptional regulator (DNA/RNA-binding 3-helical bundle fold)   PDB  2rha
2qtq
 562   376219   FL9663A   YP_495839.1   N. aromaticivorans DSM 12444   Putative TetR/AcrR family transcriptional regulator (DNA/RNA-binding 3-helical bundle fold)   PDB  2ras
 563   378075   FM11750A   SARO_25NOV03_CONTIG22_REVISED_GENE168   N. aromaticivorans DSM 12444   Protein from the NTF2-like superfamily with a cystatin-like fold   PDB  2rfr
 564   378138   FM11797A   YP_001165924.1   N. aromaticivorans DSM 12444   Putative aromatic ring hydroxylase   PDB  3b8l
 565   379617   FN12626A   SARO_25NOV03_CONTIG29_REVISED_GENE2295   N. aromaticivorans DSM 12444   LD-carboxypeptidase A [Flavodoxin-like fold, The "swivelling" beta/beta/alpha domain fold]   PDB  3g23
 566   379606   FN7543A   YP_001165900.1   N. aromaticivorans DSM 12444   Putative ribose 5-phosphate isomerase   PDB  3c5y
 567   387108   FN9260E   YP_496220.1   N. aromaticivorans DSM 12444   alpha/beta hydrolase   PDB  3bwx
 568   379619   FN9311B   YP_497011.1   N. aromaticivorans DSM 12444   Putative Acetyltransferase from the GNAT family   PDB  3ec4
 569   391042   MG11732J   YP_001165631.1   N. aromaticivorans DSM 12444   The beta subunit of a putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase.   PDB  3eby
 570   391039   MG14602A   SARO_25NOV03_CONTIG26_REVISED_GENE949   N. aromaticivorans DSM 12444   Uncharacterized cystatin fold protein (YP_497570.1) from NTF2 superfamily. It is similar to proteins from COG4538.   PDB  3ff2
 571   391050   MG14606A   YP_498036.1   N. aromaticivorans DSM 12444   Putative cystatin-like protease [Cystatin-like]   PDB  3ejv
 572   391045   MG8051B   SARO_25NOV03_CONTIG28_REVISED_GENE1520   N. aromaticivorans DSM 12444   Saro_2880 has cystatin-like fold and strong sequence similarity to proteins of unknown function from Pfam07366 (formerly DUF1486) and COG4922.   PDB  3g0k
 573   391033   MG9341A   YP_001165807.1   N. aromaticivorans DSM 12444   Protein with a cupin-like fold and unknown function.   PDB  3es1
 574   367578   NB7857A   YP_496742.1   N. aromaticivorans DSM 12444   Putative Scyalone Dehydratase   PDB  3ef8
 575   396342   PX1668C   SARO_25NOV03_CONTIG30_REVISED_GENE3122   N. aromaticivorans DSM 12444   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF192 family.   PDB  3m7a
 576   378347   PT07364A   YP_676511.1   Mesorhizobium sp. BNC1   Putative metallopeptidase   PDB  3iuu
 577   370490   FJ8827A   YP_001022847.1   M. petroleophilum PM1   putative acetylacetone dioxygenase   PDB  2o1q
 578   392100   FR14726C   YP_001021951.1   M. petroleophilum PM1   bsmA homolog [Double-stranded beta-helix]   PDB  3pl0
 579   391024   MG14597A   YP_001022489.1   M. petroleophilum PM1   Protein of unknown function with cystatin-like fold.   PDB  3g16
 580   356547   114727:124279   114727   M. musculus   Activin receptor type IIB extracellular domain in complex with activin [Snake toxin-like]   PDB  1s4y
 581   354543   13277653   13277653   M. musculus   BET3 homolog.   PDB  2pwn
1vpg
 582   380417   13542905   13542905   M. musculus   NudC domain-containing protein 2.   PDB  2rh0
 583   354741   13543033   13543033   M. musculus   Acireductone dioxygenase   PDB  1vr3
 584   354528   13879369   13879369   M. musculus   AIG2-like mouse enzyme from the gamma-glutamyl cyclotransferase family [Gamma-glutamyl cyclotransferase-like]   PDB  2kl2
1vkb
 585   354641   15079298   15079298   M. musculus   Glia maturation factor-gamma (0610039G16Rik protein) (2310057N07Rik protein) (Glia maturation factor, gamma).   PDB  1vkk
 586   358981   15277975   15277975   M. musculus   Mouse N-myc downstream regulated 2 protein, a putative esterase/lipase [Alpha/beta-Hydrolases]   PDB  2qmq
 587   354778   16740816   16740816   M. musculus   mRNA decapping enzyme.   PDB  1vlr
 588   354660   16741099   16741099   M. musculus   UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase   PDB  1vm8
 589   358966   16924205   16924205   M. musculus   Mouse Tat-interacting protein (homolog of human HIV-1 tat interacting protein TIP30).   PDB  2fmu
 590   354784   17391249   17391249   M. musculus   N-acetylneuraminic acid phosphatase (NANP)   PDB  2gfh
 591   354593   18044849   18044849   M. musculus   Bifunctional coenzyme A synthase [P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases]   PDB  2f6r
 592   354739   18204011   18204011   M. musculus   NADPH dependent oxidoreductase.   PDB  1vj1
 593   354534   18204406   18204406   M. musculus   Thiopurine methyltransferase.   PDB  2gb4
 594   400045   MA0313H   NP_038806.2   M. musculus   Putative reductase   PDB  3ln3
 595   402064   MA1400A   19388005   M. musculus   Alanine:Glyoxylate Aminotransferase [PLP-dependent transferase-like]   PDB  3kgx
3kgw
 596   421320   RF20595A   BC065142   M. musculus   Immunoglobulin I-set domain of Lrig3 protein   PDB  3so5
 597   421317   RF20609A   BC027206   M. musculus   Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L   PDB  3s01
 598   423426   RF20609A   BC027206   M. musculus   RF20609A   PDB  3tyt
 599   421759   WS20613E   BC030493   M. musculus   RNA binding motif protein 39 (RBM39)   PDB  2lq5
3s6e
 600   422854   WT2001G   BC092217   M. musculus    SH3 and SH2 domains of FYN protein   PDB  3uf4
 601   422736   WT4514D   BC043071   M. musculus   U2AF is an essential splicing factor that recognizes the 3' splice site and recruits the U2 snRNP to the branch point.   PDB  3v4m
 602   378367   PT06314A   YP_001047042.1   M. marisnigri JR1   acetoacetate decarboxylase   PDB  3cmb
 603   381816   FM11771A   NP_987166.1   M. maripaludis S2   Protein of unknown function (DUF2118, PF09891)remotely homologous to a family of biotinyl/lipoyl-carrier proteins and domains.   PDB  3d4r
 604   387106   FN0318R   NP_988299.1   M. maripaludis S2   Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent Methyltransferase [S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases]   PDB  3dlc
 605   370399   FJ9519A   MMAG_12JAN01_CONTIG3864_REVISED_GENE3092   M. magnetotacticum MS-1   COG1633: Uncharacterized conserved protein   PDB  2oh3
 606   375584   FL10727A   MMAG_12JAN01_CONTIG3880_REVISED_GENE4213   M. magnetotacticum MS-1   putative oxidoreductase   PDB  3c1a
 607   377966   FM11660A   MMAG_12JAN01_CONTIG3800_REVISED_GENE1537   M. magnetotacticum MS-1   putative AphA-like transcription factor   PDB  2rkh
 608   394528   MH11587E   MMAG_12JAN01_CONTIG3870_REVISED_GENE3381   M. magnetotacticum MS-1   Predicted metal-dependent phosphohydrolase   PDB  3kh1
 609   369153   CM5490A   NP_105057.1   M. loti   Antioxidant defense protein [AhpD-like fold]   PDB  3c1l
 610   423092   CP20730B   NP_106977.1   M. loti   Response regulator CheY-like protein   PDB  3snk
 611   386994   EK14125A   NP_106042.1   M. loti   Putative choline/ethanolamine/thiamine kinase.   PDB  3dxq
 612   366936   FG7355A   NP_103874.1   M. loti   Putative phosphatase from the HAD superfamily [HAD-like]   PDB  2o2x
 613   367212   FH7700A   NP_107146.1   M. loti   FAD-binding protein   PDB  2hq9
 614   377848   FM11563A   NP_108484.1   M. loti   Protein (NP_108484) structure is similar to carboxylesterases from Pseudomonas fluorescens (PDB code 1auo) and Bacillus cereus (PDB code 2h1i). Its sequence is similar to predicted esterases (COG0400) and phospholipases/carboxylesterases (PF02230).   PDB  3b5e
 615   378291   FM11977A   NP_106155.1   M. loti   Protein from the stress responsive A/B barrel domain group with a ferredoxin-like fold   PDB  3bde
 616   379524   FN0823I   NP_105615.1   M. loti   Putative TetR-family transcriptional regulator.   PDB  3bhq
 617   379544   FN9827A   NP_104914.1   M. loti   S-adenosylmethionine dependent methyltransferase.   PDB  3bkw
 618   375129   HP10622H   NP_106651.1   M. loti   Uncharacterized protein mlr6093 from the aspartoacylase family PF04952   PDB  2qj8
 619   390969   MG14562B   NP_107719.1   M. loti   Putative SnoaL-like polyketide cyclase [Carbohydrate phosphatase]   PDB  3hk4
 620   390987   MG14585A   NP_107505.1   M. loti   Putative aminotransferase class-III [PLP-dependent transferase-like]   PDB  3gju
 621   390988   MG14586A   NP_108339.1   M. loti   Putative isomerase from the NTF2-like family.   PDB  3fh1
 622   394461   MH0831B   NP_104211.1   M. loti   gi|13472644|ref|NP_104211.1| similar to p-aminobenzoate synthase component I [Mesorhizobium loti]   PDB  3qqm
 623   393997   MH10766A   NP_104277.1   M. loti   putative NADPH:quinone reductase [GroES-like, NAD(P)-binding Rossmann fold]   PDB  3pi7
 624   368116   PE00293D   NP_085906.1   M. loti   Putative phosphonopyruvate hydrolase [TIM beta/alpha-barrel]   PDB  2p10
 625   396313   PX15605B   NP_103587.1   M. loti   Putative ketosteroid isomerase   PDB  3hx8
 626   359364   1499583   1499583   M. jannaschii   Protein from the superfamily of RmlC-like cupins with double-stranded beta-helix fold   PDB  2b8m
 627   381877   1591455   1591455   M. jannaschii   Carboxymuconolactone decarboxylase family protein possibly involved in oxygen detoxification.   PDB  3d7i
 628   376479   FL11227A   NP_247299.1   M. jannaschii   Putative dinitrogenase with a Fe-Mo cofactor family involved in nitrogen fixation [Ribonuclease H-like motif]   PDB  2kla
2qtd
 629   390948   MG2021G   NP_247014.1   M. jannaschii   L-tyrosine decarboxylase MfnA (EC 4.1.1.25).   PDB  3f9t
 630   373077   PC02830C   1592102   M. jannaschii   V4R family, predicted small molecule binding protein MJ_1460   PDB  2osd
2oso
 631   368630   CM8004D   YP_546752.1   M. flagellatus KT   Methyltransferase FkbM   PDB  2py6
 632   375043   FB10611C   YP_544701.1   M. flagellatus KT   NADH:FMN oxidoreductase like protein in complex with FMN   PDB  3e4v
 633   371704   FK9428A   YP_546612.1   M. flagellatus KT   histidine triad (HIT) protein [HIT-like]   PDB  2oik
 634   378221   FM11862B   YP_544675.1   M. flagellatus KT   NTF2-like protein of unknown function [NTF2-like].   PDB  3duk
 635   390943   MG14579A   YP_546034.1   M. flagellatus KT   Cyclic nucleotide-binding domain (double-stranded beta-helix fold, DNA/RNA-binding 3-helical bundle fold)   PDB  3gyd
 636   394140   MH15465B   YP_544684.1   M. flagellatus KT   Thiamine-monophosphate kinase [PurM N-terminal domain-like & PurM C-terminal domain-like]   PDB  3mcq
 637   372839   PG9854E   YP_546394.1   M. flagellatus KT       PDB  2l9d
 638   374794   PJ03069C   YP_546212.1   M. flagellatus KT   Predicted acetamidase/formamidase   PDB  3b9t
 639   374190   PJ04169H   YP_544503.1   M. flagellatus KT   Putative glutathionylspermidine synthase   PDB  3n6x
 640   381068   PU10421C   YP_546622.1   M. flagellatus KT   Gamma-glutamylcysteine synthetase [alpha/beta class]   PDB  3k1t
 641   403168   MJ0823E   YP_958691.1   M. aquaeolei vt8   TetR family transcription regulator [DNA/RNA-binding 3-helical bundle]   PDB  3pas
 642   403199   MJ15805A   YP_958415.1   M. aquaeolei vt8   Putative cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein   PDB  3lyh
 643   403195   MJ5232A   YP_957926.1   M. aquaeolei vt8   Putative signal transduction protein [YbaK/ProRS associated domain & modified HD domain]   PDB  3mem
 644   403193   MJ9145D   YP_957874.1   M. aquaeolei vt8   anti-ECFsigma factor, ChrR   PDB  3o14
 645   403209   MJ9307C   YP_958980.1   M. aquaeolei vt8   Histidine triad protein [a+b class, HIT-like fold]   PDB  3ohe
 646   403231   MJ9673J   YP_960827.1   M. aquaeolei vt8   TetR-family transcriptional regulator   PDB  3nnr
 647   394855   PS04222   YP_958225.1   M. aquaeolei vt8   Protein of unknown function, DUF416   PDB  3f7c
 648   386867   GS13486B   YP_536235.1   L. salivarius subsp. salivarius ucc118   Sex pheromone (putative lipoprotein) precursor, unclear function (see e.g. Flannagan SE et al., 2002).   PDB  3ib5
 649   403139   MJ0831A   YP_094631.1   L. pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1   Putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase.   PDB  3lul
 650   403140   MJ10625B   YP_094844.1   L. pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1   M20A metallo peptidase (unassigned peptidase in Merops) [Phosphorylase/hydrolase-like]   PDB  3pfe
 651   403115   MJ9538A   YP_095238.1   L. pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1   oligo-nucleotide binding protein   PDB  3op6
 652   376561   PS06314   YP_094708.1   L. pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1   Acetoacetate decarboxylase (ADC)   PDB  3c8w
 653   418740   SP19086A   YP_095136.1   L. pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1   hypothetical protein, alpha-beta hydrolases fold     4ezi
 654   366924   FG7343A   NP_784467.1   L. plantarum   oleoyl thioesterase (putative)   PDB  2own
 655   366929   FG7348A   NP_784602.1   L. plantarum   putative phosphoglycolate phosphatase   PDB  2hdo
 656   376078   FL10768A   NP_786167.1   L. plantarum   putative dinucleotide-binding oxidoreductase   PDB  2raf
 657   378137   FM11796A   NP_783940.1   L. plantarum   Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like protein   PDB  3ba3
 658   379488   FN0414A   NP_786804.1   L. plantarum   Myo-inositol 2-dehydrogenase.   PDB  3cea
 659   379483   FN9390A   NP_786266.1   L. plantarum   Putative carboxylesterase   PDB  3bxp
 660   379491   FN9390B   NP_784706.1   L. plantarum   Putative carboxylesterase (alpha/beta hydrolase fold)   PDB  3bjr
 661   383008   FP6320A   NP_786806.1   L. plantarum   Putative inositol catabolism protein IolE (TIM beta/alpha-barrel fold)   PDB  3cny
 662   392319   FR15240A   NP_785364.1   L. plantarum   Putative RNA-binding protein   PDB  3kwr
 663   396747   GE1527P   NP_784167.1   L. plantarum   Putative transcriptional regulator [DNA/RNA-binding 3-helical bundle]   PDB  3k69
 664   360800   PC05870A   NP_786857.1   L. plantarum   p-coumaric acid decarboxylase   PDB  2gc9
 665   368074   PE00055D   NP_785678.1   L. plantarum   Bacterial protein from DUF1831 with a new fold and a putative role in protein synthesis   PDB  2iay
 666   358817   46906266   YP_012655.1   L. monocytogenes 4b F2365   Lmo0035 protein   PDB  2aml
 667   424520   EL17883Q   YP_013905.1   L. monocytogenes 4b F2365   leucine rich hypothetical protein, bacterial adhesion/invasion protein N terminal, putative cell adhesion     4ezg
 668   371703   FK8798A   YP_013417.1   L. monocytogenes 4b F2365   multiple antibiotic-resistance repressor (MarR)   PDB  2qww
 669   371602   FK9436A   YP_013287.1   L. monocytogenes 4b F2365   Putative GCN5-related N-acetyltransferase   PDB  2oh1
 670   376521   FL11266A   YP_015267.1   L. monocytogenes 4b F2365   Hypothetical NUDIX hydrolase   PDB  3son
 671   390915   MG0829T   YP_013136.1   L. monocytogenes 4b F2365   Putative sugar-phosphate isomerase.   PDB  3fxa
 672   390913   MG14572B   YP_014836.1   L. monocytogenes 4b F2365   Uncharacterized ferrodoxin fold protein related to antibiotic biosynthesis monooxygenases.   PDB  3fez
 673   390911   MG9652I   YP_013912.1   L. monocytogenes 4b F2365   Cystathionine beta-lyase family protein, ortholog of YnnB B.subtilis   PDB  3jzl
 674   367570   NB7852A   YP_013033.1   L. monocytogenes 4b F2365   Putative Glyoxalase   PDB  3e5d
 675   366145   PD06751F   YP_013784.1   L. monocytogenes 4b F2365   ethanolamine ammonia-lyase heavy chain   PDB  2qez
 676   359352   16411011   16411011   L. monocytogenes   Putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase (SAM or AdoMet-MTase) class I, a member of N-6 DNA methylase-like family   PDB  2f8l
 677   358685   16411704   16411704   L. monocytogenes   Putative sugar isomerase.   PDB  2g0w
 678   403100   MJ14477B   NP_463836.1   L. monocytogenes   putative L-allo-threonine aldolase   PDB  3pj0
 679   376562   PS06605   NP_465809.1   L. monocytogenes   prophage tail protein gp18 (was hypothetical protein DUF1142)   PDB  3gs9
 680   367190   FH7684A   NP_471338.1   L. innocua   Protein form a novel protein family that adopts a four-helical bundle fold. Structurally similar to yppE (PDB code 2im8) from Bacillus subtilis that is induced during sporulation   PDB  2huj
 681   380201   FH7686A   NP_472219.1   L. innocua   Putative Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase   PDB  3db0
 682   396743   GE8810CD   NP_470886.1   L. innocua   Putative transcriptional regulator   PDB  3lwf
 683   390900   MG14572A   NP_471648.1   L. innocua   Monooxygenase-like Protein [Dimeric alpha+beta barrel]   PDB  3fj2
 684   390899   MG9652H   NP_470671.1   L. innocua   Putative cystathionine beta-lyase involved in aluminum resistance (Pfam06838/COG4100).   PDB  3fd0
 685   394139   MH11582F   NP_471964.1   L. innocua   HD-domain phosphohydrolase [HD domain]   PDB  3mzo
 686   368054   PE00012N   NP_472245.1   L. innocua   The first structure from a Pfam family SMI/KNR4 (PF09346) involved in the regulation of 1,3-beta-glucan synthase activity and cell-wall formation   PDB  2icg
 687   366916   FG7335A   YP_813060.1   L. delbrueckii bulgaricus ATCC BAA-365   putative phosphoglycolate phosphatase   PDB  2hi0
 688   367187   FH7681A   YP_812335.1   L. delbrueckii bulgaricus ATCC BAA-365   Predicted flavin-nucleotide-binding protein from COG3576 family structurally related to pyridoxine 5'-phosphate oxidase. Putative pyridoxamine 5'-phosphate oxidase.   PDB  2htd
 689   377395   FM12053A   YP_813084.1   L. delbrueckii bulgaricus ATCC BAA-365   Putative PLP-dependent aminotransferase   PDB  3dzz
 690   375624   FL10757A   LCAS_20SEP02_SCAFFOLD4_REVISED_GENE2707   L. casei ATCC 334   putative metal-dependent hydrolase   PDB  2qpx
 691   376404   FL11215A   YP_805721.1   L. casei ATCC 334   Putative redox protein [OsmC-like]   PDB  2ql8
 692   379434   FN9394A   YP_807781.1   L. casei ATCC 334   Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase-like protein (YP_807781.1) has strong similarity to SAM-dependent methyltransferases. Cofactor binding (carbonate-ion) residues, such as His129, Trp159, and Glu158 (predicted) are required for methylene transfer activity.   PDB  3bkx
 693   392607   FR14793A   YP_807875.1   L. casei ATCC 334   PRD-containing transcription regulator. The family contains both antiterminators and activators, so cannot distinguish function more specifically at this stage.   PDB  3nuf
 694   398487   MI15907F   LCAS_20SEP02_SCAFFOLD13_REVISED_GENE898   L. casei ATCC 334   Galactose mutarotase-like protein   PDB  3q1n
 695   368040   PE00025C   YP_807469.1   L. casei ATCC 334   Protein of unknown function from DUF1801 with fold belonging to the YdhG-like SCOP family   PDB  2i8d
 696   418682   SP18772A   YP_794809.1   L. brevis atcc 367   ABC-type phosphate transport system, periplasmic component, ABC transporter, phosphate transport receptor   PDB  4ecf
 697   388454   GD9765C   YP_193882.1   L. acidophilus NCFM   Flavoprotein in Complex with FMN   PDB  3edo
 698   391714   MG11333F   YP_194538.1   L. acidophilus NCFM   Aspartate aminotransferase (E.C. 2.6.1.1). It is in the conserved genomic neighborhood of aspartate alanine antiporter.   PDB  3f6t
 699   391715   MG8150B   YP_193413.1   L. acidophilus NCFM   Putative monooxygenase. May be involved in phospholipid metabolism.   PDB  3f44
 700   388334   GD12576B   YP_001337957.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   haloacid dehalogenase-like hydrolase   PDB  3pgv
 701   390294   GS13282A   YP_001338247.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   Hypothetical aldose 1-epimerase   PDB  3ty1
 702   390050   GS13720A   YP_001336205.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   GS13720A   PDB  2l1s
 703   390051   GS13722A   YP_001337197.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   Putative nucleic acid-binding lipoprotein.   PDB  3f1z
 704   390056   GS13859A   YP_001338366.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   Periplasmic sugar-binding protein.   PDB  3d02
 705   390304   GS14063A   YP_001337144.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   Putative membrane protein of unknown function (NCBI:PRK10316). May be functionally associated with regulation of fimbrial expression and/or response to leucine.   PDB  3dza
 706   390073   GS5754A   YP_001338103.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   Putative Sel1 repeat protein   PDB  3rjv
 707   391713   MG7319A   YP_001338853.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   Uncharacterized conserved protein with double-stranded beta-helix domain.   PDB  3h8u
 708   399660   MI15944AI   YP_001338415.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   Putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system (PTS) permease [EIIA-man component-like]   PDB  3mtq
 709   388889   PK5307B   YP_001336084.1   Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   Putative Metal-dependent Hydrolase   PDB  3dl1
3khi
 710   375040   FB7482B   YP_508897.1   Jannaschia sp. CCS1   Putative general stress protein 26   PDB  2qea
 711   366909   FG7328A   YP_509914.1   Jannaschia sp. CCS1   thioesterase superfamily   PDB  2nuj
 712   370470   FJ8809A   JANN_22DEC04_CONTIG27_REVISED_GENE3582   Jannaschia sp. CCS1   thioesterase superfamily   PDB  2oaf
 713   370379   FJ9446A   YP_508196.1   Jannaschia sp. CCS1   pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein [Split barrel-like]   PDB  2ou5
 714   371655   FK9243B   YP_509982.1   Jannaschia sp. CCS1   OsmC-like hydroperoxide resistance protein   PDB  3cje
 715   377925   FM11626A   JANN_22DEC04_CONTIG18_REVISED_GENE473   Jannaschia sp. CCS1   putative TetR transcriptional regulator   PDB  3cjd
 716   378282   FM11914B   YP_511867.1   Jannaschia sp. CCS1   Dimeric ferredoxin-like protein of unknown function similar to stress responsive proteins (Pfam07876) [Plant stress-induced protein].   PDB  3bb5
 717   379416   FN11125A   YP_511008.1   Jannaschia sp. CCS1   putative oxidoreductase   PDB  3c24
 718   387115   PC07345C   YP_510488.1   Jannaschia sp. CCS1   PC07345C   PDB  2kzc
 719   366508   PD07848H   JANN_22DEC04_CONTIG27_REVISED_GENE3569   Jannaschia sp. CCS1   Putative transcriptional regulator   PDB  3l09
 720   373487   PH10062D   YP_512017.1   Jannaschia sp. CCS1   Uncharacterized protein from DUF2853   PDB  2pyq
 721   374450   PJ07336D   YP_510353.1   Jannaschia sp. CCS1   Protein of unknown function with two domains: N-terminal DUF1470 and C-terminal treble-clef Zn-finger.   PDB  2pw4
3h0n
 722   396293   PX5552B   YP_509242.1   Jannaschia sp. CCS1   Putative SnoaL-like polyketide cyclase.   PDB  3kkg
 723   403059   MJ14489A   YP_156458.1   Idiomarina loihiensis L2TR   FMN/FAD- and NAD(P)H-dependent nitroreductase   PDB  3of4
 724   401538   PL9887A   YP_156143.1   Idiomarina loihiensis L2TR   Protein of unknown function that contains Pfam Ala racemase N terminal domain (PF01168).   PDB  3llx
 725   386978   EK2269C   HSOM_08NOV04_CONTIG98_REVISED_GENE622   H. somnus 129PT   Putative fructosamine-3-kinase [protein kinase-like (PK-like)]   PDB  3jr1
 726   375038   FB10610B   HSOM_08NOV04_CONTIG98_REVISED_GENE995   H. somnus 129PT   Putative flavin reductase [split barrel-like fold]   PDB  2r0x
 727   366906   FG7325A   YP_718383.1   H. somnus 129PT   Predicted phosphoglycolate phosphatase   PDB  2hsz
 728   377798   FM11521A   YP_718263.1   H. somnus 129PT   Ribulose-5-phosphate 3-epimerase (Pfam: PF00834, NCBI: cd00429)   PDB  3cu2
 729   377935   FM11633A   YP_718332.1   H. somnus 129PT   putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase [D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes]   PDB  3ceb
 730   392534   FR14724A   YP_719632.1   H. somnus 129PT   exonuclease from YqaJ viral recombinase family   PDB  3k93
 731   375116   HP9625C   YP_718209.1   H. somnus 129PT   Putative aminoacyl-histidine dipeptidase, member of the Zn-metallopeptidase family   PDB  2qyv
 732   374865   PJ05114C   HSOM_08NOV04_CONTIG98_REVISED_GENE911   H. somnus 129PT   Protein of unknown function (DUF692/COG3220) has some similarity to endonuclease IV.   PDB  3bww
 733   356547   124279:114727   124279   H. sapiens   Mouse activin in complex with the human extracellular domain of its type II receptor [Cystine-knot cytokines]   PDB  1s4y
 734   402074   MA16085B   NP_954699.1   H. sapiens   D-ribulose-5-phosphate-3-epimerase   PDB  3qc3
 735   423470   MA16109D   NP_056528.2   H. sapiens   ribonucleotide reductase M2 B, ribonucleotide reductase small subunit, p53 inducible, oxidoreductase, DNA synthesis, nucleotide metabolism   PDB  4djn
 736   423688   RC20651B   SGT82680   H. sapiens   Complex of HMG domain of SOX-9 transcription factor with DNA   PDB  4euw
 737   421429   RF0849A   BC008182   H. sapiens   BC008182 Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:5217 IMAGE:2900892), complete cds, coding region:105-1298   PDB  2lo1
 738   421522   RF2003A   BC063280   H. sapiens   Fragment of Nuclear factor related to kappa-B-binding protein (residues 370-495)   PDB  3u21
 739   421449   RF2209A   BC111559   H. sapiens   LINE-1 type transposase domain-containing protein 1 (L1TD1)   PDB  3soo
2lr6
 740   421663   WS20613B   BC009359   H. sapiens   Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B, RNA-recognition motif (RRM)   PDB  3s7r
 741   424521   WS3220C   BC040485   H. sapiens   BC040485 Homo sapiens G-rich RNA sequence binding factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:33152 IMAGE:5271637), complete cds, coding region:71-1378   PDB  2lmi
 742   422603   WT2001B   BC013200   H. sapiens   BC013200 Homo sapiens lymphocyte-specific protein tyrosine kinase, src-Family Kinases are nonreceptor tyrosine kinases that are reported to be critical for cancer progression. Protein kinase has SH2, SH3 and Pkinase_Tyr domains (PF00017 , PF00018, PF07714).   PDB  4d8k
 743   422958   WT2001Q   NM_002737   H. sapiens   C2 domain of a protein kinase C, alpha acts as a membrane-targeting module in a diverse group of proteins including classical protein kinase Cs (PKCs)   PDB  4dnl
 744   423006   WT2001Z   NM_139355   H. sapiens   Homo sapiens megakaryocyte-associated tyrosine kinase (MATK), SH2, SH3, SRC HOMOLOGY, SIGNALING PROTEIN, TYROSINE KINASE, CYTOPLASMIC TYROSINE KINASE, TRANSFERASE . PFAM 00017 These domain structure is common for many intracellular signal-transducing proteins.   PDB  3us4
 745   422547   WT20613D   BC008875   H. sapiens   RNA binding domain of poly-U binding splicing factor 60KDa   PDB  3uwt
 746   422549   WT20613D   BC008875   H. sapiens   RNA binding domain of poly-U binding splicing factor 60KDa   PDB  3ue2
 747   422574   WT20613E   BC011265   H. sapiens   Homo sapiens poly-U binding splicing factor 60KDa, Canonical RBD, RRM, RNA BINDING, PROTEIN BINDING   PDB  3us5
 748   422757   WT20632A   BC052302   H. sapiens   RNA binding domain of THO complex subunit 4 protein   PDB  3ulh
 749   422496   WT20665A   BC003133   H. sapiens   HLA-B associated transcript 3, ubiquitin-like domain, BAT3 protein, PF00240   PDB  4dwf
 750   422541   WT20674A   BC008451   H. sapiens   Hypotherical Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E   PDB  3uch
 751   422475   WT2292A   BC001359   H. sapiens   Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, beta polypeptide 14-3-3 domain protein   PDB  4dnk
 752   422647   WT2292B   BC020963   H. sapiens   Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activa tion protein, gamma polypeptide mediate signal transduction by binding to phosphoserine-containing proteins.   PDB  4e2e
 753   422527   WT4153C   BC007195   H. sapiens   NCK adaptor protein 2, SH3 domain, protein binding   PDB  4e6r
 754   422572   WT4514A   BC010939   H. sapiens   RNA binding domain of Hypothetical POLYADENYLATE-BINDING PROTEIN   PDB  3ucg
 755   390859   MG14465B   NP_207418.1   H. pylori 26695   Aminotransferase AspB.   PDB  3ezs
 756   403041   MJ11052C   YP_135254.1   H. marismortui atcc 43049   Hypothetical CheC-like protein   PDB  3qta
 757   399392   MI0823AY   NP_439054.1   H. influenzae   TetR-family transcriptional regulator [two scop folds: Tetracyclin repressor-like, N-terminal domain & Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain]   PDB  3qkx
 758   374967   PC02153D   1574749   H. influenzae   chorismate mutase / prephenate dehydrogenase (tyrA)   PDB  2pv7
 759   374984   FG7320A   NP_954075.1   G. sulfurreducens   FG7320A   PDB  2l1t
 760   371567   FK9414A   NP_953832.1   G. sulfurreducens   OsmC-like protein   PDB  2opl
 761   390844   MG1588A   NP_951600.1   G. sulfurreducens   GGDEF domain containing [multiple domains]   PDB  3ezu
 762   394418   MH5158B   NP_953345.1   G. sulfurreducens   HDOD domain protein with unknown function, homologous to JCSG protein 1vqr, active site intact suggesting a possibly functional enzyme (metal-dependent phosphohydrolase)   PDB  3hc1
 763   367993   PE00139F   NP_952040.1   G. sulfurreducens   putative tail lysozyme   PDB  2ia7
 764   372382   PG9890A   NP_951602.1   G. sulfurreducens   methyltransferase   PDB  3c3p
 765   372393   PG9895A   NP_951123.1   G. sulfurreducens   Putative lipid binding protein (all-alpha class)   PDB  2rdc
 766   402929   MJ16273A   YP_384491.1   G. metallireducens gs-15   Putative cyclic nucleotide-binding protein [cAMP-binding domain]   PDB  3mdp
 767   402910   MJ8150A   NP_604244.1   F. nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586   Putative monooxygenase [Dimeric alpha+beta barrel]   PDB  3mcs
 768   375036   FB8805A   YP_001814466.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Putative oxidoreductase [Split barrel-like]   PDB  2q9k
 769   369798   FJ9092A   YP_001815044.1   Exiguobacterium sp. 255-15   carbamoylphosphate synthase large subunit   PDB  2pn1
 770   370251   FJ9248A   YP_001814707.1   Exiguobacterium sp. 255-15   acetoin utilization protein   PDB  2q04
 771   378014   FM11701A   YP_001813558.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Putative NTP pyrophosphohydrolase   PDB  3nl9
2rfp
3mqu
 772   377609   FM12207A   YP_001813159.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Nucleotidyltransferase-like protein with C-terminal DNA-binding domain (putative).   PDB  3c18
 773   379362   FN12569A   YP_001815201.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Putative acetyltransferase.   PDB  3gy9
3gya
 774   383355   FP0938B   YP_001813268.1   Exiguobacterium sp. 255-15   SAM-dependent methyltransferase.   PDB  3d2l
 775   392463   FR14539C   YP_001815198.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Putative phosphoheptose isomerase   PDB  3jx9
 776   396730   GE8204A   YP_001813199.1   Exiguobacterium sp. 255-15   protoporphyrinogen oxidase   PDB  3lov
 777   390836   MG0383E   YP_001815433.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Putative nitroreductase in complex with FMN [FMN-dependent nitroreductase-like]   PDB  3ge6
 778   390833   MG14474A   YP_001812677.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Putative hydroxylase from the SnoaL-like polyketide cyclase family.   PDB  3er7
 779   390840   MG14477A   YP_001813866.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Putative aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase.   PDB  3lws
 780   390842   MG14479A   YP_001814158.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Putative calcium/calmodulin-dependent kinase II association domain   PDB  3ksp
 781   361006   PC05163A   YP_001813732.1   Exiguobacterium sp. 255-15   putative member of the DinB family   PDB  2hkv
 782   380276   PC08000A   YP_001814629.1   Exiguobacterium sp. 255-15   Protein of unknown function with a PH domain.   PDB  3b77
 783   392282   FR14749A   YP_002938006.1   E. rectale   Putative exonuclease   PDB  3l0a
 784   391897   FR15091A   YP_002936568.1   E. rectale   Bacterial TIR-like protein from DUF1863   PDB  3hyn
 785   388609   GD14262A   YP_002936966.1   E. rectale   EUBREC_1070 has 50% seq. identity to ZP_04742165, a putative imidazole glycerol phosphate synthase homolog.   PDB  3e0z
 786   388491   GD4050C   YP_002937310.1   E. rectale   Putative Phosphatase [Predicted hydrolases Cof]   PDB  3dao
 787   390003   GS13306A   YP_002937831.1   E. rectale   Hypothetical 7-bladed beta-propeller-like protein   PDB  3s25
 788   391588   MG1400B   YP_002938516.1   E. rectale   Aminotransferase   PDB  3f0h
 789   391594   MG3309B   YP_002936484.1   E. rectale   Amino Transferase   PDB  3ele
 790   394339   MH15438A   YP_002935947.1   E. rectale   Putative DNA polymerase III beta subunit   PDB  3t0p
 791   389300   PK14342A   YP_002936997.1   E. rectale   NtrC-like two-domain protein.   PDB  3fkq
 792   388639   GD10876A   RER070207001219   E. rectale   Transcriptional regulator, Crp/Fnr family.   PDB  3dv8
 793   357242   29342463   EF0366   E. faecalis V583   A probable DNA-binding protein from a TIM alpha/beta barrel fold   PDB  1vpy
1ztv
 794   359291   EF3048   EF3048   E. faecalis V583   Putative cellobiose-phosphate cleavage protein from the YdjC family   PDB  2i5i
 795   392681   FR14854A   NP_814290.1   E. faecalis V583   Putative RNA binding/RNA chaperone [PUA domain-like]   PDB  3iuw
 796   424084   GS13741A   NP_814968.1   E. faecalis V583   gi|29375814|ref|NP_814968.1| hypothetical protein EF1241 [Enterococcus faecalis V583]   PDB  2llg
 797   389964   GS13767A   NP_815223.1   E. faecalis V583   putative beta-lactamase   PDB  3cjm
 798   375213   RK10657A   NP_815490.1   E. faecalis V583   Putative kinase from the ribokinase-like superfamily [YjeF C-terminal domain-like]   PDB  2r3b
2r3e
 799   375214   RK10658A   NP_816404.1   E. faecalis V583   4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole kinase (EC 2.7.1.50).   PDB  3dzv
 800   420196   SP17422AB   NP_816142.1   E. faecalis V583   Pheromone cOB1 precursor/lipoprotein, YaeC family, periplasmic methionine binding protein, NLPA lipoprotein   PDB  4ef1
4ef2
 801   355840   1790429   1790429   E. coli K12   NADH pyrophosphatase (EC 3.6.1.-).   PDB  2gb5
1vk6
 802   379351   FN12316A   NP_416804.1   E. coli K12   Glutathione S-transferase.   PDB  3bby
 803   394118   MH15503A   NP_418508.1   E. coli K12    D-allose kinase   PDB  3htv
 804   398554   MI15905D   NP_417039.1   E. coli K12   Putative aldose 1-epimerase [Galactose mutarotase-like]   PDB  3nre
 805   358288   NP416953   NP_416953.1   E. coli K12   Ethanolamine utilization protein eutD.   PDB  1vmi
 806   358298   NP417084   NP_417084.1   E. coli K12   Putative laccase [YfiH-like]   PDB  1z9t
 807   358289   NP417374   NP_417374.1   E. coli K12   Putative aminomethyltransferase   PDB  1vly
 808   358290   NP417381   NP_417381.1   E. coli K12   aminomethyltransferase (T protein; tetrahydrofolate-dependent) of glycine cleavage system   PDB  1vlo
 809   396279   PX7069A   NP_415897.1   E. coli K12   Heat shock protein hslJ.   PDB  2kts
 810   369785   FJ9081A   YP_050235.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   putative oxidoreductase   PDB  2p2s
 811   371321   FK4030A   YP_049838.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Putative methyltransferase [S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases]   PDB  2p7i
2p7h
 812   371338   FK9098B   YP_049261.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Putative QueC, a pyrophosphatase of the queuosine biosynthesis pathway   PDB  2pg3
 813   378184   FM11835A   YP_049581.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Ketosteroid isomerase-like protein with an unknown ligand. The ligand is bound in a deep aromatic cleft containing conserved Tyr19, Glu110, and Tyr127.   PDB  3d9r
 814   379345   FN9870A   YP_051181.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Putative YdeN-like alpha/beta hydrolases protein from the DUF1234 group [Alpha/beta-Hydrolases]   PDB  3bdv
 815   390788   MG14518A   YP_050331.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Putative delta-5-3-ketosteroid isomerase.   PDB  3f8x
 816   394440   MH15451A   YP_050048.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Putative sugar isomerase   PDB  3ktc
 817   367548   NB7833A   YP_050007.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Protein of unknown function   PDB  3cjl
 818   367950   PE00003C   YP_049917.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   TetR-family transcriptional regulator   PDB  2hyt
 819   372199   PG8359C   YP_051588.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Protein with unknown function which belongs to Pfam DUF3225 family [NTF2-like].   PDB  2rcd
 820   396273   PX14503B   YP_050345.1   E. carotovora atroseptica SCRI1043   Putative histidinol-phosphate aminotransferase   PDB  3ly1
 821   379259   FN12543A   DHAF_12NOV03_CONTIG1044_REVISED_GENE999   Desulfitobacterium hafniense DCB-2   Putative NADPH-dependent oxidoreductase.   PDB  3db2
 822   390756   MG0120A   DHAF_12NOV03_CONTIG1004_REVISED_GENE78   Desulfitobacterium hafniense DCB-2   Nitroreductase with bound FMN [FMN-dependent nitroreductase-like]   PDB  3pxv
 823   361000   PC02663C   DHAF_12NOV03_CONTIG982_REVISED_GENE4728   Desulfitobacterium hafniense DCB-2   Formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein   PDB  2glz
 824   360984   PC04016A   DHAF_12NOV03_CONTIG1056_REVISED_GENE1477   Desulfitobacterium hafniense DCB-2   Protein with unknown function from DUF364 family   PDB  3l5o
2h1q
 825   360990   PC06253A   DHAF_12NOV03_CONTIG1082_REVISED_GENE2974   Desulfitobacterium hafniense DCB-2   putative methyltransferase   PDB  2qne
 826   394351   MH11753A   YP_009526.1   D. vulgaris Hildenborough   Putative chemotaxis protein CheX   PDB  3h4y
 827   405735   TT6205B   YP_010117.1   D. vulgaris Hildenborough   Putative gamma-D-glutamyl-L-diamino acid endopeptidase   PDB  3m1u
 828   357203   6457846   6457846   D. radiodurans   Transposase IS200 like.   PDB  2fyx
 829   357226   6459694   6459694   D. radiodurans   protein with unknown function from DUF162 family   PDB  2g40
 830   370329   FJ9406A   NP_294789.1   D. radiodurans   Putative metalloenzyme from DUF664 family   PDB  2ou6
 831   376366   FL11185A   NP_295401.1   D. radiodurans   Hypotetical acetyltransferase   PDB  3s6f
 832   379311   FN12557A   NP_295428.1   D. radiodurans   Predicted hydrolase of haloacid dehalogenase-like superfamily.   PDB  3cnh
 833   390777   MG14516A   NP_295823.1   D. radiodurans   Putative antibiotic biosynthesis monooxygenase with ferredoxin-like fold   PDB  3e8o
 834   394616   MH15483A   NP_295729.1   D. radiodurans   Protein with unknown function.   PDB  3nqn
 835   366882   FG7303A   YP_518966.1   D. hafniense Y51   Cupin superfamily protein   PDB  2ozj
 836   371529   FK5490E   YP_604910.1   D. geothermalis DSM 11300   Uncharacterized peroxidase-related protein   PDB  2oyo
 837   390750   MG10808B   DGEO_15APR04_CONTIG105_REVISED_GENE503   D. geothermalis DSM 11300   Transcriptional regulator, Crp/Fnr family.   PDB  3e97
 838   390749   MG14492C   YP_604413.1   D. geothermalis DSM 11300   Putative aminotransferase (MocR family). This protein may be functionally associated with bacterial regulatory proteins (GntR superfamily).   PDB  3ez1
 839   366877   FG7298A   YP_388795.1   D. desulfuricans G20   Protein from the superfamily of RmlC-like cupins [Double-stranded beta-helix]   PDB  2q30
 840   376338   FL11216A   YP_389533.1   D. desulfuricans G20   Putative acetyltransferase [N-acetyl transferase, NAT]   PDB  2r7h
 841   377310   FM11964A   YP_390128.1   D. desulfuricans G20   putative acetyltransferase   PDB  3c8v
 842   379240   FN11585A   YP_389115.1   D. desulfuricans G20   putative nucleotide-diphospho-sugar transferase   PDB  3cgx
 843   375105   HP1666A   DDES_06JUN05_CONTIG143_REVISED_GENEDDE1186   D. desulfuricans G20   co-catalytic metallopeptidase   PDB  2rb7
 844   390745   MG0383I   YP_387283.1   D. desulfuricans G20   Putative nitroreductase in complex with FMN (FMN-dependent nitroreductase-like fold)   PDB  3e39
 845   390748   MG8818A   DDES_06JUN05_CONTIG143_REVISED_GENEDDE3696   D. desulfuricans G20   dTDP Sugar Isomerase   PDB  3ejk
 846   394179   MH11753H   YP_386777.1   D. desulfuricans G20   Chemotaxis protein CheX phosphatase [CheC-like].   PDB  3hm4
 847   402769   MJ16252A   YP_270605.1   Colwellia psychrerythraea 34H   NTF2-like protein of unknown function   PDB  3lyg
 848   401373   PL9868A   YP_269720.1   Colwellia psychrerythraea 34H   Hypothetical DinB-like protein   PDB  3qth
 849   402579   MJ0968E   NP_900990.1   Chromobacterium violaceum ATCC 12472   Putative hydrolase from the isochorismatase family.   PDB  3mcw
 850   366871   FG7292A   NP_662590.1   C. tepidum TLS   Hydrolase from haloacid dehalogenase-like family   PDB  2hcf
 851   376232   FL10974A   NP_661249.1   C. tepidum TLS   Putative FMN-dependent nitroreductase   PDB  2r01
 852   390740   MG14507A   NP_661805.1   C. tepidum TLS   CT0912, ORFan protein from Chlorobium tepidum with a ferrodoxin-like domain repeat   PDB  3gn6
 853   366651   NP_663012.1   NP_663012.1   C. tepidum TLS   TPR-like protein [alpha-alpha superhelix]   PDB  2hr2
 854   402861   MJ4130B   YP_574786.1   C. salexigens dsm 3043   Putative 6-phosphogluconolactonase   PDB  3lwd
 855   391683   MG14470H   YP_878790.1   C. novyi NT   putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase   PDB  3odp
 856   391675   MG14486B   YP_877874.1   C. novyi NT   Nitroreductase family protein.   PDB  3g14
 857   391679   MG9652S   YP_878183.1   C. novyi NT   Carbon-sulfur lyase involved in aluminum resistance.   PDB  3i16
3gwp
 858   356952   6967725   6967725   C. jejuni   virulence factor CJ0248, from the HDOD domain family [HD-domain/PDEase-like]   PDB  1vqr
 859   377381   FM12041A   NP_282733.1   C. jejuni   Putative 2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N-succinyltransferase (single-stranded left-handed beta-helix fold)   PDB  2rij
 860   391926   FR15108A   NP_281412.1   C. jejuni   Putative NTF2-like transpeptidase [cystatin-like]   PDB  3k7c
 861   390730   MG14503A   NP_281508.1   C. jejuni   Putative histidinol-phosphate aminotransferase that according to predictions from STRING server, is functionally associated with enzymes from phenylalanine metabolism, and biosynthesis of phenylalanine, tyrosine and tryptophan.   PDB  3get
 862   366867   FG7288A   YP_679100.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   possible sugar phosphatase, HAD superfamily   PDB  2hx1
 863   367128   FH7626A   YP_677622.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase.   PDB  3ch0
 864   376375   FL11193A   YP_677306.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   Putative DNA damage-inducible protein (DinB/YfiT-like putative metalloenzymes fold)   PDB  2qnl
 865   378214   FM11842B   YP_678039.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   NTF2-like protein   PDB  2r4i
 866   375102   HP10638A   YP_676701.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   putative M42 glutamyl aminopeptidase   PDB  3cpx
 867   390729   MG14498B   YP_677612.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   Phosphoserine aminotransferase SerC (EC 2.6.1.52) [PLP-dependent transferases].   PDB  3ffr
 868   390726   MG14500A   YP_680363.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   NTF2-like protein with structural similarity to the ketosteroid isomerase-like family.   PDB  3f14
 869   390727   MG14501A   YP_677363.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   NTF2-like protein with structural similarity with the Limonene Epoxide Hydrolase (LEH) family.   PDB  3f40
 870   394475   MH10719B   YP_676759.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   Putative phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase   PDB  3kiz
 871   394547   MH15473A   YP_678483.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   Hypothetical sugar kinase   PDB  3r8e
 872   397998   MI16003A   YP_676947.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   Putative exopolyphosphatase [Ppx/GppA phosphatase]   PDB  3mdq
 873   372359   PG1132I   YP_676785.1   C. hutchinsonii ATCC 33406   Putative ATPase   PDB  2r44
 874   375029   FB9776D   NP_601736.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   Putative pyridoxamine 5'-phosphate oxidase   PDB  3fkh
 875   370503   FJ8838A   NP_599989.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   Putative haloacid dehalogenase-like hydrolase   PDB  2pr7
 876   370229   FJ9230A   NP_600854.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   Transcriptional regulator from TetR family (homeodomain-like superfamily, DNA/RNA-binding 3-helical bundle fold)   PDB  2o7t
 877   373193   FJ9319A   NP_600742.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferase   PDB  2qec
 878   375784   FL11009A   NP_600288.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   Putative phosphoenolpyruvate phosphonomutase   PDB  2qiw
 879   375605   FL1347A   NP_599840.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein   PDB  2qr6
 880   377822   FM11540A   NP_601885.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   DUF2520 from the 6-Phosphogluconate Dehydrogenase-Like Family, and a putative Rossmann-like dehydrogenase activity.   PDB  3dfu
 881   376512   HP3342D   NP_600337.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   N-succinyl-L,L-diaminopimelate desuccinylase (EC 3.5.1.18) (ArgE) from Corynebacterium glutamicum ATCC 13032, a homolog of E. coli DapE   PDB  3tx8
 882   390716   MG14492B   NP_599493.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   aspartate transaminase [PLP-dependent transferase-like]   PDB  3ppl
 883   394438   MH10855D   NP_602249.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   Putative alcohol dehydrogenase   PDB  3iv7
 884   394391   MH12164A   NP_601778.2   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   Hypothetical aminotransferase   PDB  3sno
 885   372498   PG2288B   NP_600671.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   TehB-like SAM-dependent methyltransferase.   PDB  3cgg
 886   374698   PJ02153E   NP_599479.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   Putative prephenate dehydrogenase   PDB  3ktd
 887   375206   RK10655A   NP_599410.1   C. glutamicum ATCC 13032 Kitasato   5-keto-2-deoxygluconokinase [Ribokinase-like]   PDB  3pl2
 888   1315   CE21227   CE21227   C. elegans   inositol-3-phosphate synthase. VF13D12L.3 protein.   PDB  1vko
 889   366862   FG7283A   NP_939744.1   C. diphtheriae   pyrimidine reductase-like protein   PDB  2p4g
 890   390709   MG14491A   NP_940074.1   C. diphtheriae   Putative PLP-dependent beta-cystathionase (Beta C-S lyase) [PLP-dependent transferase-like]   PDB  3fdb
 891   398877   MI0823A   NP_940126.1   C. diphtheriae   TetR family regulatory protein [contains two scop folds:Tetracyclin repressor-like, N-terminal domain & Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain]   PDB  3npi
 892   388088   GD4176A   YP_001086940.1   C. difficile 630   Putative haloacid dehalogenase-like hydrolase.   PDB  3fzq
 893   390377   GS13199A   YP_001089212.1   C. difficile 630   Hypothetical sugar binding protein   PDB  3qi7
 894   391649   MG0383AD   YP_001089721.1   C. difficile 630   Putative nitroreductase in complex with FMN.   PDB  3gfa
 895   391659   MG0383AE   YP_001089088.1   C. difficile 630   BluB-like flavoprotein. BluB triggers an unusual fragmentation of the FMN cofactor.   PDB  3eo8
 896   391667   MG0383AF   YP_001089872.1   C. difficile 630   Putative nitroreductase [FMN-dependent nitroreductase-like]   PDB  3koq
3h4o
 897   391665   MG14656B   YP_001089791.1   C. difficile 630   Double-SIS domain protein, putative phosphosugar isomerase   PDB  3g68
 898   399389   MI11708B   YP_001088069.1   C. difficile 630   MarR family transcriptional regulator [MarR-like transcriptional regulators]   PDB  3nqo
 899   418336   SP19336A   YP_001088123.1   C. difficile 630   putative lipoprotein, YPEB domain dimer     4exr
 900   355823   13421216   13421216   C. crescentus   DNA-binding protein, putative deacylase.   PDB  1vjf
 901   369423   CM8385A   NP_419930.1   C. crescentus   Histidine Phosphotransferase ShpA   PDB  2ooc
 902   366861   FG7282A   NP_422103.1   C. crescentus   thioesterase superfamily protein [Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase]   PDB  2hbo
 903   378287   FM11923A   NP_421070.1   C. crescentus   Dimeric ferredoxin-like protein belongs to Pfam DABB family [Plant stress-induced protein].   PDB  3bn7
 904   378310   FM11993A   NP_420935.1   C. crescentus   Putative antibiotic biosynthesis monooxygenase with ferredoxin-like fold and superfamily of dimeric alpha+beta barrels.   PDB  3bm7
 905   390707   MG14490A   NP_419375.1   C. crescentus   Ferritin like protein from Caulobacter crescentus CB15; putative metal binding protein   PDB  3hl1
 906   398027   MI15887S   NP_419019.1   C. crescentus   A putative 2OG-Fe(II) oxygenase [Double-stranded beta-helix]   PDB  3oox
 907   424729   NP_422278.1   NP_422278.1   C. crescentus   tyrosine kinase DivL, signal transduction, two-component regulatory system, HisKA domain, GHKL domain     4ew8
 908   396244   PX15624A   NP_421374.1   C. crescentus   Uncharacterized NTF2-like protein with a cystatin-like fold   PDB  3gzr
 909   423081   CP20738C   CAUR_25MAY01_CONTIG1105_REVISED_GENE1902   C. aurantiacus J-10-fl   Hypothetical RESPONSE REGULATOR   PDB  3t6k
 910   369930   FJ9298A   YP_001635876.1   C. aurantiacus J-10-fl   PAS and DNA binding domain containing protein [Lambda repressor-like DNA-binding domains/Profilin-like]   PDB  3pxp
 911   377939   FM11637A   CAUR_25MAY01_CONTIG1062_REVISED_GENE931   C. aurantiacus J-10-fl   Putative kinase [P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases]   PDB  2rhm
 912   394390   MH5846C   YP_001636057.1   C. aurantiacus J-10-fl   Putative dihydrofolate reductase   PDB  3kgy
 913   399264   MI10991B   YP_001635819.1   C. aurantiacus J-10-fl   TetR transcriptional regulator   PDB  3qbm
 914   399092   MI9424B   YP_001636308.1   C. aurantiacus J-10-fl   TetR family transcriptional regulator   PDB  3nrg
 915   357074   15023806   15023806   C. acetobutylicum   Uncharacterized conserved protein YjbQ/UPF0047 family, ortholog yugU B.subtilis. [YjbQ-like]   PDB  1vmh
 916   355809   15025322   15025322   C. acetobutylicum   DTDP-4-dehydrorhamnose reductase, rfbD ortholog [NAD(P)-binding Rossmann-fold]   PDB  1vl0
 917   357129   15026306   15026306   C. acetobutylicum   Probable 2-phosphosulfolactate phosphatase (EC 3.1.3.71).   PDB  1vr0
 918   366858   FG7279A   NP_350077.1   C. acetobutylicum   Protein related to general stress protein 26 (GS26) of B.subtilis. It belongs to PNP-oxidase like family   PDB  2hq7
 919   367116   FH7614A   NP_349178.1   C. acetobutylicum   Protein sequence related to the NimC/NimA family of S. enterica. Its structure belongs to the PNP-oxidase like family.   PDB  2ig6
 920   379134   FN0285A   NP_348253.1   C. acetobutylicum   Glycerol dehydrogenase.   PDB  3ce9
 921   379155   FN10807A   NP_350189.1   C. acetobutylicum   predicted DNA-binding transcriptional regulator of TetR/AcrR family   PDB  3b81
 922   393080   HP10623B   NP_348812.1   C. acetobutylicum   Zinc peptidase [multidomain alpha/beta class with central alpha/beta/alpha sandwich]   PDB  3k9t
 923   390674   MG0383C   NP_348178.1   C. acetobutylicum   Putative NADH Oxidase   PDB  3e10
 924   390679   MG9652B   NP_348457.1   C. acetobutylicum   The gene CA_C1833 from CLOSTRIDIUM ACETOBUTYLICUM contains a putative aluminum resistance protein.   PDB  3hvy
 925   397745   MI15933A   NP_347334.1   C. acetobutylicum   galactose mutarotase-like protein   PDB  3os7
 926   367850   PE00002C   NP_347894.1   C. acetobutylicum   Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism.   PDB  3ccg
 927   372432   PG9905A   NP_349143.1   C. acetobutylicum   S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase   PDB  2p8j
 928   417957   SP16880A   ZP_02071651.1   Bacteroides uniformis   hypothetical protein, unknown function protein DUF3823 (PF12866)     4eiu
 929   423062   UP20725R   ZP_02072861.1   Bacteroides uniformis   transcription anti-terminator antagonist UpxZ inhibits transcription of heterologous capsular polysaccharide loci in Bacteroides species by interfering with the action of the UpxY family of transcription anti-terminators. First representative of the PFAM UpxZ (PF06603) family. Joint project with Laurie Comstock     4epz
 930   416748   SP1225A   ZP_02066624.1   Bacteroides ovatus   glycosyl hydrolase   PDB  3qc2
 931   416712   SP12873A   ZP_02066800.1   Bacteroides ovatus   imelysin peptidase   PDB  3n8u
3oyv
 932   416999   SP13115C   ZP_02068518.1   Bacteroides ovatus   Putative periplasmic protein, unknown function, two domains (DUF2874) protein.   PDB  4dsd
 933   416975   SP13250B   ZP_02067217.1   Bacteroides ovatus   hypothetical protein, PF14717 family protein, DUF446     4e9k
 934   416927   SP13279C   ZP_02067316.1   Bacteroides ovatus   hypothetical protein, PF14730 family protein, DUF4468 with TBP-like fold     4e6f
 935   416711   SP13469A   ZP_02063708.1   Bacteroides ovatus   metallo-endopeptidase   PDB  3p1v
 936   416742   SP13645A   ZP_02066194.1   Bacteroides ovatus   Putative sugar hydrolase   PDB  3nmb
 937   416920   SP13771A   ZP_02066989.1   Bacteroides ovatus   hypothetical protein, has three domains, the first domain belongs to PFAM PF01522 (Polysaccharide deacetylase), the second one is beta barrel, and the third one is three-helix bundle.   PDB